Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF6

Efcc1, EF-hand and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efcc1Q9JJF6 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Efcc1Q9JJF6 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Efcc1Q9JJF6 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Efcc1Q9JJF6 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Efcc1Q9JJF6 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Efcc1Q9JJF6 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Efcc1Q9JJF6 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Efcc1Q9JJF6 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Efcc1Q9JJF6 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Efcc1Q9JJF6 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Efcc1Q9JJF6 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Efcc1Q9JJF6 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Efcc1Q9JJF6 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Efcc1Q9JJF6 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Efcc1Q9JJF6 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Efcc1Q9JJF6 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Efcc1Q9JJF6 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Efcc1Q9JJF6 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Efcc1Q9JJF6 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Efcc1Q9JJF6 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Efcc1Q9JJF6 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Efcc1Q9JJF6 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Efcc1Q9JJF6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Efcc1Q9JJF6 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Efcc1Q9JJF6 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Efcc1Q9JJF6 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Efcc1Q9JJF6 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Efcc1Q9JJF6 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Efcc1Q9JJF6 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Efcc1Q9JJF6 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Efcc1Q9JJF6 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Efcc1Q9JJF6 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Efcc1Q9JJF6 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Efcc1Q9JJF6 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Efcc1Q9JJF6 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Efcc1Q9JJF6 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Efcc1Q9JJF6 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Efcc1Q9JJF6 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Efcc1Q9JJF6 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Efcc1Q9JJF6 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Efcc1Q9JJF6 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Efcc1Q9JJF6 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Efcc1Q9JJF6 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Efcc1Q9JJF6 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Efcc1Q9JJF6 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Efcc1Q9JJF6 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Efcc1Q9JJF6 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Efcc1Q9JJF6 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Efcc1Q9JJF6 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Efcc1Q9JJF6 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Efcc1Q9JJF6 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Efcc1Q9JJF6 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Efcc1Q9JJF6 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Efcc1Q9JJF6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Efcc1Q9JJF6 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Efcc1Q9JJF6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Efcc1Q9JJF6 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Efcc1Q9JJF6 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Efcc1Q9JJF6 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Efcc1Q9JJF6 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Efcc1Q9JJF6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Efcc1Q9JJF6 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Efcc1Q9JJF6 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Efcc1Q9JJF6 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Efcc1Q9JJF6 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Efcc1Q9JJF6 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Efcc1Q9JJF6 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Efcc1Q9JJF6 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Efcc1Q9JJF6 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Efcc1Q9JJF6 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Efcc1Q9JJF6 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Efcc1Q9JJF6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Efcc1Q9JJF6 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Efcc1Q9JJF6 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Efcc1Q9JJF6 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Efcc1Q9JJF6 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Efcc1Q9JJF6 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Efcc1Q9JJF6 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Efcc1Q9JJF6 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Efcc1Q9JJF6 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Efcc1Q9JJF6 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Efcc1Q9JJF6 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Efcc1Q9JJF6 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Efcc1Q9JJF6 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Efcc1Q9JJF6 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Efcc1Q9JJF6 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Efcc1Q9JJF6 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Efcc1Q9JJF6 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Efcc1Q9JJF6 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Efcc1Q9JJF6 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Efcc1Q9JJF6 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Efcc1Q9JJF6 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Efcc1Q9JJF6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Efcc1Q9JJF6 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Efcc1Q9JJF6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Efcc1Q9JJF6 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Efcc1Q9JJF6 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Efcc1Q9JJF6 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Efcc1Q9JJF6 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Efcc1Q9JJF6 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms