Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHK4

Rabggta, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtaQ9JHK4 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RabggtaQ9JHK4 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RabggtaQ9JHK4 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RabggtaQ9JHK4 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RabggtaQ9JHK4 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RabggtaQ9JHK4 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RabggtaQ9JHK4 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RabggtaQ9JHK4 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RabggtaQ9JHK4 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
RabggtaQ9JHK4 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RabggtaQ9JHK4 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RabggtaQ9JHK4 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RabggtaQ9JHK4 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RabggtaQ9JHK4 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RabggtaQ9JHK4 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RabggtaQ9JHK4 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RabggtaQ9JHK4 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RabggtaQ9JHK4 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RabggtaQ9JHK4 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
RabggtaQ9JHK4 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RabggtaQ9JHK4 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC25■■□□□ 1.59
RabggtaQ9JHK4 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
RabggtaQ9JHK4 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RabggtaQ9JHK4 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RabggtaQ9JHK4 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RabggtaQ9JHK4 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RabggtaQ9JHK4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RabggtaQ9JHK4 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RabggtaQ9JHK4 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RabggtaQ9JHK4 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RabggtaQ9JHK4 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
RabggtaQ9JHK4 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RabggtaQ9JHK4 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RabggtaQ9JHK4 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RabggtaQ9JHK4 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RabggtaQ9JHK4 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RabggtaQ9JHK4 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RabggtaQ9JHK4 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RabggtaQ9JHK4 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RabggtaQ9JHK4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RabggtaQ9JHK4 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RabggtaQ9JHK4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RabggtaQ9JHK4 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RabggtaQ9JHK4 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RabggtaQ9JHK4 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RabggtaQ9JHK4 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RabggtaQ9JHK4 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RabggtaQ9JHK4 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RabggtaQ9JHK4 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RabggtaQ9JHK4 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RabggtaQ9JHK4 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RabggtaQ9JHK4 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RabggtaQ9JHK4 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RabggtaQ9JHK4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RabggtaQ9JHK4 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RabggtaQ9JHK4 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RabggtaQ9JHK4 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RabggtaQ9JHK4 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
RabggtaQ9JHK4 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
RabggtaQ9JHK4 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RabggtaQ9JHK4 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RabggtaQ9JHK4 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RabggtaQ9JHK4 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RabggtaQ9JHK4 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RabggtaQ9JHK4 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RabggtaQ9JHK4 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RabggtaQ9JHK4 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RabggtaQ9JHK4 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RabggtaQ9JHK4 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RabggtaQ9JHK4 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RabggtaQ9JHK4 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RabggtaQ9JHK4 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RabggtaQ9JHK4 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RabggtaQ9JHK4 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RabggtaQ9JHK4 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RabggtaQ9JHK4 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RabggtaQ9JHK4 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RabggtaQ9JHK4 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RabggtaQ9JHK4 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RabggtaQ9JHK4 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RabggtaQ9JHK4 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
RabggtaQ9JHK4 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RabggtaQ9JHK4 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RabggtaQ9JHK4 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RabggtaQ9JHK4 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RabggtaQ9JHK4 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RabggtaQ9JHK4 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RabggtaQ9JHK4 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RabggtaQ9JHK4 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RabggtaQ9JHK4 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
RabggtaQ9JHK4 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RabggtaQ9JHK4 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RabggtaQ9JHK4 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RabggtaQ9JHK4 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RabggtaQ9JHK4 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RabggtaQ9JHK4 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RabggtaQ9JHK4 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RabggtaQ9JHK4 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RabggtaQ9JHK4 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RabggtaQ9JHK4 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
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