Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHH5

Cxcl11, C-X-C motif chemokine 11, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl11Q9JHH5 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cxcl11Q9JHH5 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cxcl11Q9JHH5 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cxcl11Q9JHH5 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cxcl11Q9JHH5 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cxcl11Q9JHH5 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cxcl11Q9JHH5 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cxcl11Q9JHH5 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Cxcl11Q9JHH5 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cxcl11Q9JHH5 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cxcl11Q9JHH5 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cxcl11Q9JHH5 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cxcl11Q9JHH5 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cxcl11Q9JHH5 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cxcl11Q9JHH5 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cxcl11Q9JHH5 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cxcl11Q9JHH5 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cxcl11Q9JHH5 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cxcl11Q9JHH5 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cxcl11Q9JHH5 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cxcl11Q9JHH5 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cxcl11Q9JHH5 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cxcl11Q9JHH5 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cxcl11Q9JHH5 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cxcl11Q9JHH5 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cxcl11Q9JHH5 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cxcl11Q9JHH5 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cxcl11Q9JHH5 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cxcl11Q9JHH5 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cxcl11Q9JHH5 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cxcl11Q9JHH5 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cxcl11Q9JHH5 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cxcl11Q9JHH5 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cxcl11Q9JHH5 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cxcl11Q9JHH5 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cxcl11Q9JHH5 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cxcl11Q9JHH5 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cxcl11Q9JHH5 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cxcl11Q9JHH5 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cxcl11Q9JHH5 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cxcl11Q9JHH5 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cxcl11Q9JHH5 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cxcl11Q9JHH5 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cxcl11Q9JHH5 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cxcl11Q9JHH5 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cxcl11Q9JHH5 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cxcl11Q9JHH5 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Cxcl11Q9JHH5 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Cxcl11Q9JHH5 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cxcl11Q9JHH5 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cxcl11Q9JHH5 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cxcl11Q9JHH5 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cxcl11Q9JHH5 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cxcl11Q9JHH5 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cxcl11Q9JHH5 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cxcl11Q9JHH5 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cxcl11Q9JHH5 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cxcl11Q9JHH5 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cxcl11Q9JHH5 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cxcl11Q9JHH5 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cxcl11Q9JHH5 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cxcl11Q9JHH5 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cxcl11Q9JHH5 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cxcl11Q9JHH5 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cxcl11Q9JHH5 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cxcl11Q9JHH5 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cxcl11Q9JHH5 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cxcl11Q9JHH5 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cxcl11Q9JHH5 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cxcl11Q9JHH5 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cxcl11Q9JHH5 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cxcl11Q9JHH5 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cxcl11Q9JHH5 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cxcl11Q9JHH5 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cxcl11Q9JHH5 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cxcl11Q9JHH5 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cxcl11Q9JHH5 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cxcl11Q9JHH5 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cxcl11Q9JHH5 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cxcl11Q9JHH5 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cxcl11Q9JHH5 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cxcl11Q9JHH5 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cxcl11Q9JHH5 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cxcl11Q9JHH5 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cxcl11Q9JHH5 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cxcl11Q9JHH5 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Cxcl11Q9JHH5 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cxcl11Q9JHH5 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Cxcl11Q9JHH5 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Cxcl11Q9JHH5 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cxcl11Q9JHH5 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cxcl11Q9JHH5 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cxcl11Q9JHH5 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cxcl11Q9JHH5 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cxcl11Q9JHH5 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Cxcl11Q9JHH5 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cxcl11Q9JHH5 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cxcl11Q9JHH5 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cxcl11Q9JHH5 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cxcl11Q9JHH5 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms