Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp29Q9ES63 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp29Q9ES63 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp29Q9ES63 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp29Q9ES63 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp29Q9ES63 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp29Q9ES63 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp29Q9ES63 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp29Q9ES63 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp29Q9ES63 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp29Q9ES63 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp29Q9ES63 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp29Q9ES63 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp29Q9ES63 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp29Q9ES63 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp29Q9ES63 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp29Q9ES63 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp29Q9ES63 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp29Q9ES63 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Usp29Q9ES63 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Usp29Q9ES63 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Usp29Q9ES63 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Usp29Q9ES63 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Usp29Q9ES63 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Usp29Q9ES63 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp29Q9ES63 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp29Q9ES63 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp29Q9ES63 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp29Q9ES63 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp29Q9ES63 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp29Q9ES63 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp29Q9ES63 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp29Q9ES63 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp29Q9ES63 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp29Q9ES63 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp29Q9ES63 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp29Q9ES63 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp29Q9ES63 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp29Q9ES63 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp29Q9ES63 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp29Q9ES63 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp29Q9ES63 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp29Q9ES63 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp29Q9ES63 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp29Q9ES63 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp29Q9ES63 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp29Q9ES63 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp29Q9ES63 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp29Q9ES63 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp29Q9ES63 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp29Q9ES63 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp29Q9ES63 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Usp29Q9ES63 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp29Q9ES63 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp29Q9ES63 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp29Q9ES63 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp29Q9ES63 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Usp29Q9ES63 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp29Q9ES63 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp29Q9ES63 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp29Q9ES63 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Usp29Q9ES63 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Usp29Q9ES63 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp29Q9ES63 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp29Q9ES63 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp29Q9ES63 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp29Q9ES63 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp29Q9ES63 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp29Q9ES63 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp29Q9ES63 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp29Q9ES63 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp29Q9ES63 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp29Q9ES63 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Usp29Q9ES63 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp29Q9ES63 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp29Q9ES63 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp29Q9ES63 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Usp29Q9ES63 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp29Q9ES63 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp29Q9ES63 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp29Q9ES63 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp29Q9ES63 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp29Q9ES63 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp29Q9ES63 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp29Q9ES63 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp29Q9ES63 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp29Q9ES63 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp29Q9ES63 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp29Q9ES63 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp29Q9ES63 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp29Q9ES63 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp29Q9ES63 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp29Q9ES63 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp29Q9ES63 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp29Q9ES63 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp29Q9ES63 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp29Q9ES63 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp29Q9ES63 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp29Q9ES63 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp29Q9ES63 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms