Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERI2

Rab27a, Ras-related protein Rab-27A, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab27aQ9ERI2 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rab27aQ9ERI2 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rab27aQ9ERI2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rab27aQ9ERI2 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rab27aQ9ERI2 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rab27aQ9ERI2 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rab27aQ9ERI2 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rab27aQ9ERI2 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rab27aQ9ERI2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rab27aQ9ERI2 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rab27aQ9ERI2 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rab27aQ9ERI2 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rab27aQ9ERI2 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rab27aQ9ERI2 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rab27aQ9ERI2 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rab27aQ9ERI2 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rab27aQ9ERI2 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rab27aQ9ERI2 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rab27aQ9ERI2 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Rab27aQ9ERI2 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rab27aQ9ERI2 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rab27aQ9ERI2 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rab27aQ9ERI2 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rab27aQ9ERI2 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rab27aQ9ERI2 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rab27aQ9ERI2 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rab27aQ9ERI2 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rab27aQ9ERI2 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rab27aQ9ERI2 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rab27aQ9ERI2 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rab27aQ9ERI2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rab27aQ9ERI2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rab27aQ9ERI2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Rab27aQ9ERI2 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rab27aQ9ERI2 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rab27aQ9ERI2 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rab27aQ9ERI2 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rab27aQ9ERI2 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rab27aQ9ERI2 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rab27aQ9ERI2 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rab27aQ9ERI2 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rab27aQ9ERI2 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rab27aQ9ERI2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rab27aQ9ERI2 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rab27aQ9ERI2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rab27aQ9ERI2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rab27aQ9ERI2 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rab27aQ9ERI2 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rab27aQ9ERI2 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rab27aQ9ERI2 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rab27aQ9ERI2 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rab27aQ9ERI2 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Rab27aQ9ERI2 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rab27aQ9ERI2 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rab27aQ9ERI2 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Rab27aQ9ERI2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rab27aQ9ERI2 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rab27aQ9ERI2 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rab27aQ9ERI2 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rab27aQ9ERI2 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rab27aQ9ERI2 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rab27aQ9ERI2 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rab27aQ9ERI2 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rab27aQ9ERI2 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rab27aQ9ERI2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rab27aQ9ERI2 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rab27aQ9ERI2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rab27aQ9ERI2 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rab27aQ9ERI2 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rab27aQ9ERI2 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rab27aQ9ERI2 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rab27aQ9ERI2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rab27aQ9ERI2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rab27aQ9ERI2 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rab27aQ9ERI2 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rab27aQ9ERI2 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rab27aQ9ERI2 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rab27aQ9ERI2 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rab27aQ9ERI2 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rab27aQ9ERI2 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Rab27aQ9ERI2 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rab27aQ9ERI2 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rab27aQ9ERI2 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rab27aQ9ERI2 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rab27aQ9ERI2 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rab27aQ9ERI2 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rab27aQ9ERI2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rab27aQ9ERI2 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rab27aQ9ERI2 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rab27aQ9ERI2 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rab27aQ9ERI2 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rab27aQ9ERI2 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rab27aQ9ERI2 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rab27aQ9ERI2 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rab27aQ9ERI2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rab27aQ9ERI2 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rab27aQ9ERI2 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rab27aQ9ERI2 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rab27aQ9ERI2 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rab27aQ9ERI2 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms