Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER56

Capn12, Calpain-12, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn12Q9ER56 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Capn12Q9ER56 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Capn12Q9ER56 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Capn12Q9ER56 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Capn12Q9ER56 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Capn12Q9ER56 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Capn12Q9ER56 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Capn12Q9ER56 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Capn12Q9ER56 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Capn12Q9ER56 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Capn12Q9ER56 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Capn12Q9ER56 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Capn12Q9ER56 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Capn12Q9ER56 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Capn12Q9ER56 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Capn12Q9ER56 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Capn12Q9ER56 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Capn12Q9ER56 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Capn12Q9ER56 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Capn12Q9ER56 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Capn12Q9ER56 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Capn12Q9ER56 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Capn12Q9ER56 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Capn12Q9ER56 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Capn12Q9ER56 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Capn12Q9ER56 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Capn12Q9ER56 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Capn12Q9ER56 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Capn12Q9ER56 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Capn12Q9ER56 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Capn12Q9ER56 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Capn12Q9ER56 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Capn12Q9ER56 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Capn12Q9ER56 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Capn12Q9ER56 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Capn12Q9ER56 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Capn12Q9ER56 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Capn12Q9ER56 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Capn12Q9ER56 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Capn12Q9ER56 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Capn12Q9ER56 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Capn12Q9ER56 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Capn12Q9ER56 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Capn12Q9ER56 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Capn12Q9ER56 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Capn12Q9ER56 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Capn12Q9ER56 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Capn12Q9ER56 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Capn12Q9ER56 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Capn12Q9ER56 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Capn12Q9ER56 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Capn12Q9ER56 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Capn12Q9ER56 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Capn12Q9ER56 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Capn12Q9ER56 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Capn12Q9ER56 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Capn12Q9ER56 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Capn12Q9ER56 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Capn12Q9ER56 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Capn12Q9ER56 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Capn12Q9ER56 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Capn12Q9ER56 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Capn12Q9ER56 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Capn12Q9ER56 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Capn12Q9ER56 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Capn12Q9ER56 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Capn12Q9ER56 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Capn12Q9ER56 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Capn12Q9ER56 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Capn12Q9ER56 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Capn12Q9ER56 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Capn12Q9ER56 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Capn12Q9ER56 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Capn12Q9ER56 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Capn12Q9ER56 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Capn12Q9ER56 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Capn12Q9ER56 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Capn12Q9ER56 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Capn12Q9ER56 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Capn12Q9ER56 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Capn12Q9ER56 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Capn12Q9ER56 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Capn12Q9ER56 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Capn12Q9ER56 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Capn12Q9ER56 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Capn12Q9ER56 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Capn12Q9ER56 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Capn12Q9ER56 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Capn12Q9ER56 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Capn12Q9ER56 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Capn12Q9ER56 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Capn12Q9ER56 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Capn12Q9ER56 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Capn12Q9ER56 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Capn12Q9ER56 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Capn12Q9ER56 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Capn12Q9ER56 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Capn12Q9ER56 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Capn12Q9ER56 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Capn12Q9ER56 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms