Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQZ6

Rapgef4, Rap guanine nucleotide exchange factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,011 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef4Q9EQZ6 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rapgef4Q9EQZ6 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rapgef4Q9EQZ6 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rapgef4Q9EQZ6 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rapgef4Q9EQZ6 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rapgef4Q9EQZ6 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rapgef4Q9EQZ6 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rapgef4Q9EQZ6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rapgef4Q9EQZ6 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rapgef4Q9EQZ6 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rapgef4Q9EQZ6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Rapgef4Q9EQZ6 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Rapgef4Q9EQZ6 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Rapgef4Q9EQZ6 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Rapgef4Q9EQZ6 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Rapgef4Q9EQZ6 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rapgef4Q9EQZ6 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rapgef4Q9EQZ6 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rapgef4Q9EQZ6 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rapgef4Q9EQZ6 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Rapgef4Q9EQZ6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rapgef4Q9EQZ6 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rapgef4Q9EQZ6 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rapgef4Q9EQZ6 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rapgef4Q9EQZ6 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rapgef4Q9EQZ6 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Rapgef4Q9EQZ6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rapgef4Q9EQZ6 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rapgef4Q9EQZ6 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rapgef4Q9EQZ6 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rapgef4Q9EQZ6 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Rapgef4Q9EQZ6 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rapgef4Q9EQZ6 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Rapgef4Q9EQZ6 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Rapgef4Q9EQZ6 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rapgef4Q9EQZ6 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rapgef4Q9EQZ6 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rapgef4Q9EQZ6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rapgef4Q9EQZ6 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rapgef4Q9EQZ6 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rapgef4Q9EQZ6 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Rapgef4Q9EQZ6 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Rapgef4Q9EQZ6 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rapgef4Q9EQZ6 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rapgef4Q9EQZ6 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rapgef4Q9EQZ6 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rapgef4Q9EQZ6 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rapgef4Q9EQZ6 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Rapgef4Q9EQZ6 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rapgef4Q9EQZ6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rapgef4Q9EQZ6 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rapgef4Q9EQZ6 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rapgef4Q9EQZ6 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rapgef4Q9EQZ6 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rapgef4Q9EQZ6 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rapgef4Q9EQZ6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rapgef4Q9EQZ6 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rapgef4Q9EQZ6 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rapgef4Q9EQZ6 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Rapgef4Q9EQZ6 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rapgef4Q9EQZ6 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rapgef4Q9EQZ6 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rapgef4Q9EQZ6 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rapgef4Q9EQZ6 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rapgef4Q9EQZ6 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rapgef4Q9EQZ6 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rapgef4Q9EQZ6 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rapgef4Q9EQZ6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rapgef4Q9EQZ6 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Rapgef4Q9EQZ6 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Rapgef4Q9EQZ6 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Rapgef4Q9EQZ6 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Rapgef4Q9EQZ6 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Rapgef4Q9EQZ6 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Rapgef4Q9EQZ6 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Rapgef4Q9EQZ6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Rapgef4Q9EQZ6 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rapgef4Q9EQZ6 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rapgef4Q9EQZ6 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rapgef4Q9EQZ6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rapgef4Q9EQZ6 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rapgef4Q9EQZ6 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Rapgef4Q9EQZ6 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rapgef4Q9EQZ6 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rapgef4Q9EQZ6 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rapgef4Q9EQZ6 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rapgef4Q9EQZ6 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rapgef4Q9EQZ6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rapgef4Q9EQZ6 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Rapgef4Q9EQZ6 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rapgef4Q9EQZ6 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rapgef4Q9EQZ6 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rapgef4Q9EQZ6 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rapgef4Q9EQZ6 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rapgef4Q9EQZ6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rapgef4Q9EQZ6 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rapgef4Q9EQZ6 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rapgef4Q9EQZ6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rapgef4Q9EQZ6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rapgef4Q9EQZ6 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
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