Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQU3

Tlr9, Toll-like receptor 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr9Q9EQU3 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tlr9Q9EQU3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tlr9Q9EQU3 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tlr9Q9EQU3 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tlr9Q9EQU3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tlr9Q9EQU3 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tlr9Q9EQU3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tlr9Q9EQU3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tlr9Q9EQU3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tlr9Q9EQU3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tlr9Q9EQU3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tlr9Q9EQU3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tlr9Q9EQU3 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tlr9Q9EQU3 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tlr9Q9EQU3 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tlr9Q9EQU3 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tlr9Q9EQU3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tlr9Q9EQU3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tlr9Q9EQU3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tlr9Q9EQU3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tlr9Q9EQU3 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tlr9Q9EQU3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tlr9Q9EQU3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Tlr9Q9EQU3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tlr9Q9EQU3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tlr9Q9EQU3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tlr9Q9EQU3 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tlr9Q9EQU3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tlr9Q9EQU3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tlr9Q9EQU3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tlr9Q9EQU3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tlr9Q9EQU3 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tlr9Q9EQU3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tlr9Q9EQU3 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Tlr9Q9EQU3 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tlr9Q9EQU3 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tlr9Q9EQU3 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Tlr9Q9EQU3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tlr9Q9EQU3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tlr9Q9EQU3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tlr9Q9EQU3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tlr9Q9EQU3 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tlr9Q9EQU3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tlr9Q9EQU3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tlr9Q9EQU3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tlr9Q9EQU3 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tlr9Q9EQU3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Tlr9Q9EQU3 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tlr9Q9EQU3 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tlr9Q9EQU3 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tlr9Q9EQU3 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tlr9Q9EQU3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tlr9Q9EQU3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tlr9Q9EQU3 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tlr9Q9EQU3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tlr9Q9EQU3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tlr9Q9EQU3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tlr9Q9EQU3 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tlr9Q9EQU3 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tlr9Q9EQU3 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Tlr9Q9EQU3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tlr9Q9EQU3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tlr9Q9EQU3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tlr9Q9EQU3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tlr9Q9EQU3 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tlr9Q9EQU3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tlr9Q9EQU3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Tlr9Q9EQU3 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tlr9Q9EQU3 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tlr9Q9EQU3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tlr9Q9EQU3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tlr9Q9EQU3 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tlr9Q9EQU3 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tlr9Q9EQU3 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tlr9Q9EQU3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tlr9Q9EQU3 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tlr9Q9EQU3 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tlr9Q9EQU3 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Tlr9Q9EQU3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tlr9Q9EQU3 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tlr9Q9EQU3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tlr9Q9EQU3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tlr9Q9EQU3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tlr9Q9EQU3 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tlr9Q9EQU3 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tlr9Q9EQU3 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tlr9Q9EQU3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tlr9Q9EQU3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tlr9Q9EQU3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tlr9Q9EQU3 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tlr9Q9EQU3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tlr9Q9EQU3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tlr9Q9EQU3 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tlr9Q9EQU3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tlr9Q9EQU3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tlr9Q9EQU3 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tlr9Q9EQU3 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tlr9Q9EQU3 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tlr9Q9EQU3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tlr9Q9EQU3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms