Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ2

Rpgrip1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpgrip1Q9EPQ2 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Rpgrip1Q9EPQ2 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Rpgrip1Q9EPQ2 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Rpgrip1Q9EPQ2 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Rpgrip1Q9EPQ2 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Rpgrip1Q9EPQ2 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Rpgrip1Q9EPQ2 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Rpgrip1Q9EPQ2 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC32.85■■■□□ 2.85
Rpgrip1Q9EPQ2 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Rpgrip1Q9EPQ2 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Rpgrip1Q9EPQ2 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.85■■■□□ 2.85
Rpgrip1Q9EPQ2 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Rpgrip1Q9EPQ2 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
Rpgrip1Q9EPQ2 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
Rpgrip1Q9EPQ2 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Rpgrip1Q9EPQ2 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Rpgrip1Q9EPQ2 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC32.83■■■□□ 2.85
Rpgrip1Q9EPQ2 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
Rpgrip1Q9EPQ2 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Rpgrip1Q9EPQ2 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
Rpgrip1Q9EPQ2 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.85
Rpgrip1Q9EPQ2 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.85
Rpgrip1Q9EPQ2 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
Rpgrip1Q9EPQ2 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Rpgrip1Q9EPQ2 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Rpgrip1Q9EPQ2 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
Rpgrip1Q9EPQ2 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Rpgrip1Q9EPQ2 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
Rpgrip1Q9EPQ2 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
Rpgrip1Q9EPQ2 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Rpgrip1Q9EPQ2 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Rpgrip1Q9EPQ2 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Rpgrip1Q9EPQ2 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Rpgrip1Q9EPQ2 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
Rpgrip1Q9EPQ2 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Rpgrip1Q9EPQ2 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Rpgrip1Q9EPQ2 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC32.78■■■□□ 2.84
Rpgrip1Q9EPQ2 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Rpgrip1Q9EPQ2 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Rpgrip1Q9EPQ2 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
Rpgrip1Q9EPQ2 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Rpgrip1Q9EPQ2 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Rpgrip1Q9EPQ2 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Rpgrip1Q9EPQ2 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC32.76■■■□□ 2.83
Rpgrip1Q9EPQ2 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
Rpgrip1Q9EPQ2 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Rpgrip1Q9EPQ2 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
Rpgrip1Q9EPQ2 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Rpgrip1Q9EPQ2 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC32.75■■■□□ 2.83
Rpgrip1Q9EPQ2 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Rpgrip1Q9EPQ2 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Rpgrip1Q9EPQ2 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Rpgrip1Q9EPQ2 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Rpgrip1Q9EPQ2 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Rpgrip1Q9EPQ2 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Rpgrip1Q9EPQ2 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Rpgrip1Q9EPQ2 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
Rpgrip1Q9EPQ2 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
Rpgrip1Q9EPQ2 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Rpgrip1Q9EPQ2 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC32.71■■■□□ 2.83
Rpgrip1Q9EPQ2 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
Rpgrip1Q9EPQ2 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
Rpgrip1Q9EPQ2 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
Rpgrip1Q9EPQ2 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Rpgrip1Q9EPQ2 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Rpgrip1Q9EPQ2 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Rpgrip1Q9EPQ2 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC32.69■■■□□ 2.82
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC32.69■■■□□ 2.82
Rpgrip1Q9EPQ2 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Rpgrip1Q9EPQ2 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Rpgrip1Q9EPQ2 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
Rpgrip1Q9EPQ2 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Rpgrip1Q9EPQ2 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
Rpgrip1Q9EPQ2 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
Rpgrip1Q9EPQ2 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Rpgrip1Q9EPQ2 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Rpgrip1Q9EPQ2 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
Rpgrip1Q9EPQ2 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC32.66■■■□□ 2.82
Rpgrip1Q9EPQ2 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
Rpgrip1Q9EPQ2 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Rpgrip1Q9EPQ2 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Rpgrip1Q9EPQ2 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Rpgrip1Q9EPQ2 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.5 ms