Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Clstn1Q9EPL2 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Clstn1Q9EPL2 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Clstn1Q9EPL2 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Clstn1Q9EPL2 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Clstn1Q9EPL2 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Clstn1Q9EPL2 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Clstn1Q9EPL2 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Clstn1Q9EPL2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Clstn1Q9EPL2 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Clstn1Q9EPL2 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Clstn1Q9EPL2 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Clstn1Q9EPL2 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Clstn1Q9EPL2 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Clstn1Q9EPL2 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Clstn1Q9EPL2 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Clstn1Q9EPL2 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Clstn1Q9EPL2 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Clstn1Q9EPL2 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Clstn1Q9EPL2 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Clstn1Q9EPL2 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Clstn1Q9EPL2 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Clstn1Q9EPL2 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Clstn1Q9EPL2 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Clstn1Q9EPL2 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Clstn1Q9EPL2 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Clstn1Q9EPL2 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Clstn1Q9EPL2 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Clstn1Q9EPL2 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Clstn1Q9EPL2 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Clstn1Q9EPL2 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Clstn1Q9EPL2 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Clstn1Q9EPL2 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Clstn1Q9EPL2 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Clstn1Q9EPL2 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Clstn1Q9EPL2 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Clstn1Q9EPL2 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Clstn1Q9EPL2 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Clstn1Q9EPL2 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Clstn1Q9EPL2 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Clstn1Q9EPL2 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Clstn1Q9EPL2 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Clstn1Q9EPL2 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Clstn1Q9EPL2 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Clstn1Q9EPL2 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Clstn1Q9EPL2 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Clstn1Q9EPL2 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Clstn1Q9EPL2 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Clstn1Q9EPL2 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Clstn1Q9EPL2 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Clstn1Q9EPL2 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Clstn1Q9EPL2 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Clstn1Q9EPL2 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Clstn1Q9EPL2 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Clstn1Q9EPL2 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Clstn1Q9EPL2 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Clstn1Q9EPL2 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Clstn1Q9EPL2 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Clstn1Q9EPL2 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Clstn1Q9EPL2 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Clstn1Q9EPL2 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Clstn1Q9EPL2 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Clstn1Q9EPL2 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Clstn1Q9EPL2 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Clstn1Q9EPL2 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Clstn1Q9EPL2 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Clstn1Q9EPL2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Clstn1Q9EPL2 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Clstn1Q9EPL2 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Clstn1Q9EPL2 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Clstn1Q9EPL2 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Clstn1Q9EPL2 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Clstn1Q9EPL2 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Clstn1Q9EPL2 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Clstn1Q9EPL2 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Clstn1Q9EPL2 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Clstn1Q9EPL2 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Clstn1Q9EPL2 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Clstn1Q9EPL2 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Clstn1Q9EPL2 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Clstn1Q9EPL2 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Clstn1Q9EPL2 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Clstn1Q9EPL2 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Clstn1Q9EPL2 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Clstn1Q9EPL2 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Clstn1Q9EPL2 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Clstn1Q9EPL2 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Clstn1Q9EPL2 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Clstn1Q9EPL2 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Clstn1Q9EPL2 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Clstn1Q9EPL2 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Clstn1Q9EPL2 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Clstn1Q9EPL2 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Clstn1Q9EPL2 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Clstn1Q9EPL2 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Clstn1Q9EPL2 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Clstn1Q9EPL2 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Clstn1Q9EPL2 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Clstn1Q9EPL2 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Clstn1Q9EPL2 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms