Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCB3

MNCb-2875, Putative uncharacterized protein FLJ38447 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 74 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MNCb-2875Q9DCB3 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MNCb-2875Q9DCB3 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MNCb-2875Q9DCB3 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MNCb-2875Q9DCB3 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MNCb-2875Q9DCB3 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MNCb-2875Q9DCB3 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MNCb-2875Q9DCB3 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MNCb-2875Q9DCB3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MNCb-2875Q9DCB3 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MNCb-2875Q9DCB3 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
MNCb-2875Q9DCB3 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MNCb-2875Q9DCB3 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MNCb-2875Q9DCB3 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MNCb-2875Q9DCB3 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MNCb-2875Q9DCB3 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MNCb-2875Q9DCB3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MNCb-2875Q9DCB3 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MNCb-2875Q9DCB3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MNCb-2875Q9DCB3 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MNCb-2875Q9DCB3 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MNCb-2875Q9DCB3 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
MNCb-2875Q9DCB3 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MNCb-2875Q9DCB3 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MNCb-2875Q9DCB3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MNCb-2875Q9DCB3 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MNCb-2875Q9DCB3 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MNCb-2875Q9DCB3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MNCb-2875Q9DCB3 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MNCb-2875Q9DCB3 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MNCb-2875Q9DCB3 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MNCb-2875Q9DCB3 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MNCb-2875Q9DCB3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MNCb-2875Q9DCB3 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MNCb-2875Q9DCB3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MNCb-2875Q9DCB3 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MNCb-2875Q9DCB3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MNCb-2875Q9DCB3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MNCb-2875Q9DCB3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MNCb-2875Q9DCB3 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MNCb-2875Q9DCB3 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MNCb-2875Q9DCB3 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MNCb-2875Q9DCB3 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MNCb-2875Q9DCB3 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MNCb-2875Q9DCB3 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MNCb-2875Q9DCB3 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MNCb-2875Q9DCB3 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MNCb-2875Q9DCB3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MNCb-2875Q9DCB3 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MNCb-2875Q9DCB3 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MNCb-2875Q9DCB3 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MNCb-2875Q9DCB3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MNCb-2875Q9DCB3 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MNCb-2875Q9DCB3 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MNCb-2875Q9DCB3 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
MNCb-2875Q9DCB3 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MNCb-2875Q9DCB3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MNCb-2875Q9DCB3 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MNCb-2875Q9DCB3 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MNCb-2875Q9DCB3 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MNCb-2875Q9DCB3 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MNCb-2875Q9DCB3 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MNCb-2875Q9DCB3 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MNCb-2875Q9DCB3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MNCb-2875Q9DCB3 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MNCb-2875Q9DCB3 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MNCb-2875Q9DCB3 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MNCb-2875Q9DCB3 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MNCb-2875Q9DCB3 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
MNCb-2875Q9DCB3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MNCb-2875Q9DCB3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MNCb-2875Q9DCB3 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MNCb-2875Q9DCB3 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MNCb-2875Q9DCB3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MNCb-2875Q9DCB3 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MNCb-2875Q9DCB3 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MNCb-2875Q9DCB3 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MNCb-2875Q9DCB3 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MNCb-2875Q9DCB3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
MNCb-2875Q9DCB3 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MNCb-2875Q9DCB3 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MNCb-2875Q9DCB3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MNCb-2875Q9DCB3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MNCb-2875Q9DCB3 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MNCb-2875Q9DCB3 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MNCb-2875Q9DCB3 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MNCb-2875Q9DCB3 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MNCb-2875Q9DCB3 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MNCb-2875Q9DCB3 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MNCb-2875Q9DCB3 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MNCb-2875Q9DCB3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MNCb-2875Q9DCB3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MNCb-2875Q9DCB3 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MNCb-2875Q9DCB3 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MNCb-2875Q9DCB3 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MNCb-2875Q9DCB3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MNCb-2875Q9DCB3 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MNCb-2875Q9DCB3 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MNCb-2875Q9DCB3 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MNCb-2875Q9DCB3 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MNCb-2875Q9DCB3 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms