Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC28

Csnk1d, Casein kinase I isoform delta, mousemouse

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1dQ9DC28 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Csnk1dQ9DC28 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Csnk1dQ9DC28 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Csnk1dQ9DC28 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Csnk1dQ9DC28 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Csnk1dQ9DC28 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Csnk1dQ9DC28 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Csnk1dQ9DC28 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Csnk1dQ9DC28 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Csnk1dQ9DC28 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Csnk1dQ9DC28 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Csnk1dQ9DC28 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Csnk1dQ9DC28 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Csnk1dQ9DC28 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Csnk1dQ9DC28 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Csnk1dQ9DC28 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Csnk1dQ9DC28 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Csnk1dQ9DC28 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Csnk1dQ9DC28 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Csnk1dQ9DC28 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Csnk1dQ9DC28 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Csnk1dQ9DC28 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Csnk1dQ9DC28 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Csnk1dQ9DC28 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Csnk1dQ9DC28 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Csnk1dQ9DC28 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Csnk1dQ9DC28 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Csnk1dQ9DC28 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Csnk1dQ9DC28 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Csnk1dQ9DC28 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Csnk1dQ9DC28 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Csnk1dQ9DC28 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Csnk1dQ9DC28 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Csnk1dQ9DC28 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Csnk1dQ9DC28 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Csnk1dQ9DC28 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Csnk1dQ9DC28 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Csnk1dQ9DC28 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Csnk1dQ9DC28 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Csnk1dQ9DC28 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Csnk1dQ9DC28 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Csnk1dQ9DC28 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Csnk1dQ9DC28 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Csnk1dQ9DC28 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Csnk1dQ9DC28 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Csnk1dQ9DC28 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Csnk1dQ9DC28 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Csnk1dQ9DC28 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Csnk1dQ9DC28 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Csnk1dQ9DC28 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Csnk1dQ9DC28 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Csnk1dQ9DC28 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Csnk1dQ9DC28 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Csnk1dQ9DC28 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Csnk1dQ9DC28 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Csnk1dQ9DC28 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Csnk1dQ9DC28 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Csnk1dQ9DC28 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Csnk1dQ9DC28 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Csnk1dQ9DC28 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Csnk1dQ9DC28 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Csnk1dQ9DC28 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Csnk1dQ9DC28 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Csnk1dQ9DC28 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Csnk1dQ9DC28 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Csnk1dQ9DC28 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Csnk1dQ9DC28 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Csnk1dQ9DC28 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Csnk1dQ9DC28 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Csnk1dQ9DC28 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Csnk1dQ9DC28 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Csnk1dQ9DC28 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Csnk1dQ9DC28 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Csnk1dQ9DC28 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Csnk1dQ9DC28 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Csnk1dQ9DC28 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Csnk1dQ9DC28 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Csnk1dQ9DC28 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Csnk1dQ9DC28 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Csnk1dQ9DC28 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Csnk1dQ9DC28 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Csnk1dQ9DC28 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Csnk1dQ9DC28 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Csnk1dQ9DC28 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Csnk1dQ9DC28 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Csnk1dQ9DC28 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Csnk1dQ9DC28 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Csnk1dQ9DC28 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Csnk1dQ9DC28 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Csnk1dQ9DC28 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Csnk1dQ9DC28 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Csnk1dQ9DC28 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Csnk1dQ9DC28 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Csnk1dQ9DC28 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Csnk1dQ9DC28 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Csnk1dQ9DC28 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Csnk1dQ9DC28 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Csnk1dQ9DC28 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Csnk1dQ9DC28 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Csnk1dQ9DC28 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
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