Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU3

Riok3, Serine/threonine-protein kinase RIO3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok3Q9DBU3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Riok3Q9DBU3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Riok3Q9DBU3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Riok3Q9DBU3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Riok3Q9DBU3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Riok3Q9DBU3 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Riok3Q9DBU3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Riok3Q9DBU3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Riok3Q9DBU3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Riok3Q9DBU3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Riok3Q9DBU3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Riok3Q9DBU3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Riok3Q9DBU3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Riok3Q9DBU3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Riok3Q9DBU3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Riok3Q9DBU3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Riok3Q9DBU3 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Riok3Q9DBU3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Riok3Q9DBU3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Riok3Q9DBU3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Riok3Q9DBU3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Riok3Q9DBU3 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Riok3Q9DBU3 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Riok3Q9DBU3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Riok3Q9DBU3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Riok3Q9DBU3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Riok3Q9DBU3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Riok3Q9DBU3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Riok3Q9DBU3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Riok3Q9DBU3 Mrgpra4-201ENSMUST00000087092 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Riok3Q9DBU3 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Riok3Q9DBU3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Riok3Q9DBU3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Riok3Q9DBU3 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Riok3Q9DBU3 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Riok3Q9DBU3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Riok3Q9DBU3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Riok3Q9DBU3 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Riok3Q9DBU3 Gm6546-201ENSMUST00000192096 766 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Riok3Q9DBU3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Riok3Q9DBU3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Riok3Q9DBU3 AC154634.3-201ENSMUST00000224589 736 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Riok3Q9DBU3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Riok3Q9DBU3 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Riok3Q9DBU3 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Riok3Q9DBU3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Riok3Q9DBU3 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Riok3Q9DBU3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Riok3Q9DBU3 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Riok3Q9DBU3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Riok3Q9DBU3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Riok3Q9DBU3 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Riok3Q9DBU3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Riok3Q9DBU3 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Riok3Q9DBU3 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Riok3Q9DBU3 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Riok3Q9DBU3 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Riok3Q9DBU3 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Riok3Q9DBU3 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Riok3Q9DBU3 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Riok3Q9DBU3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Riok3Q9DBU3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Riok3Q9DBU3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Riok3Q9DBU3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Riok3Q9DBU3 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Riok3Q9DBU3 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Riok3Q9DBU3 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Riok3Q9DBU3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Riok3Q9DBU3 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Riok3Q9DBU3 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Riok3Q9DBU3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Riok3Q9DBU3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Riok3Q9DBU3 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Riok3Q9DBU3 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Riok3Q9DBU3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Riok3Q9DBU3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Riok3Q9DBU3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Riok3Q9DBU3 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Riok3Q9DBU3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Riok3Q9DBU3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Riok3Q9DBU3 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Riok3Q9DBU3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Riok3Q9DBU3 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Riok3Q9DBU3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Riok3Q9DBU3 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Riok3Q9DBU3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Riok3Q9DBU3 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Riok3Q9DBU3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Riok3Q9DBU3 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Riok3Q9DBU3 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Riok3Q9DBU3 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Riok3Q9DBU3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Riok3Q9DBU3 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Riok3Q9DBU3 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Riok3Q9DBU3 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Riok3Q9DBU3 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Riok3Q9DBU3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Riok3Q9DBU3 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Riok3Q9DBU3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Riok3Q9DBU3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms