Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc97Q9DBT3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc97Q9DBT3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc97Q9DBT3 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc97Q9DBT3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc97Q9DBT3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc97Q9DBT3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc97Q9DBT3 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc97Q9DBT3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc97Q9DBT3 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc97Q9DBT3 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc97Q9DBT3 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc97Q9DBT3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc97Q9DBT3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc97Q9DBT3 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc97Q9DBT3 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc97Q9DBT3 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc97Q9DBT3 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc97Q9DBT3 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc97Q9DBT3 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc97Q9DBT3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc97Q9DBT3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc97Q9DBT3 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc97Q9DBT3 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc97Q9DBT3 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc97Q9DBT3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc97Q9DBT3 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc97Q9DBT3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc97Q9DBT3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc97Q9DBT3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc97Q9DBT3 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc97Q9DBT3 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc97Q9DBT3 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc97Q9DBT3 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc97Q9DBT3 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc97Q9DBT3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc97Q9DBT3 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc97Q9DBT3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc97Q9DBT3 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc97Q9DBT3 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc97Q9DBT3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc97Q9DBT3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc97Q9DBT3 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc97Q9DBT3 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc97Q9DBT3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc97Q9DBT3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc97Q9DBT3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc97Q9DBT3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc97Q9DBT3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc97Q9DBT3 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc97Q9DBT3 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc97Q9DBT3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc97Q9DBT3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc97Q9DBT3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ccdc97Q9DBT3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ccdc97Q9DBT3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ccdc97Q9DBT3 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc97Q9DBT3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc97Q9DBT3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc97Q9DBT3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc97Q9DBT3 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc97Q9DBT3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc97Q9DBT3 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc97Q9DBT3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc97Q9DBT3 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc97Q9DBT3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc97Q9DBT3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc97Q9DBT3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc97Q9DBT3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc97Q9DBT3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc97Q9DBT3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc97Q9DBT3 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc97Q9DBT3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc97Q9DBT3 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc97Q9DBT3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc97Q9DBT3 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc97Q9DBT3 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc97Q9DBT3 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc97Q9DBT3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc97Q9DBT3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc97Q9DBT3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc97Q9DBT3 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc97Q9DBT3 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc97Q9DBT3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc97Q9DBT3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc97Q9DBT3 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc97Q9DBT3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc97Q9DBT3 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc97Q9DBT3 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc97Q9DBT3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc97Q9DBT3 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc97Q9DBT3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc97Q9DBT3 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc97Q9DBT3 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc97Q9DBT3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc97Q9DBT3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc97Q9DBT3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc97Q9DBT3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc97Q9DBT3 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc97Q9DBT3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms