Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBE9

Ftsj3, pre-rRNA processing protein FTSJ3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ftsj3Q9DBE9 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ftsj3Q9DBE9 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Ftsj3Q9DBE9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ftsj3Q9DBE9 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ftsj3Q9DBE9 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ftsj3Q9DBE9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ftsj3Q9DBE9 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ftsj3Q9DBE9 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ftsj3Q9DBE9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ftsj3Q9DBE9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ftsj3Q9DBE9 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ftsj3Q9DBE9 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ftsj3Q9DBE9 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ftsj3Q9DBE9 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ftsj3Q9DBE9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ftsj3Q9DBE9 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ftsj3Q9DBE9 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ftsj3Q9DBE9 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ftsj3Q9DBE9 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ftsj3Q9DBE9 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Ftsj3Q9DBE9 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ftsj3Q9DBE9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ftsj3Q9DBE9 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ftsj3Q9DBE9 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ftsj3Q9DBE9 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ftsj3Q9DBE9 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ftsj3Q9DBE9 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ftsj3Q9DBE9 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ftsj3Q9DBE9 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Ftsj3Q9DBE9 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ftsj3Q9DBE9 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ftsj3Q9DBE9 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ftsj3Q9DBE9 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ftsj3Q9DBE9 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ftsj3Q9DBE9 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ftsj3Q9DBE9 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ftsj3Q9DBE9 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ftsj3Q9DBE9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ftsj3Q9DBE9 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ftsj3Q9DBE9 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ftsj3Q9DBE9 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ftsj3Q9DBE9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ftsj3Q9DBE9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ftsj3Q9DBE9 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ftsj3Q9DBE9 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ftsj3Q9DBE9 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ftsj3Q9DBE9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ftsj3Q9DBE9 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ftsj3Q9DBE9 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ftsj3Q9DBE9 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ftsj3Q9DBE9 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ftsj3Q9DBE9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ftsj3Q9DBE9 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ftsj3Q9DBE9 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ftsj3Q9DBE9 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Ftsj3Q9DBE9 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ftsj3Q9DBE9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ftsj3Q9DBE9 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ftsj3Q9DBE9 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ftsj3Q9DBE9 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ftsj3Q9DBE9 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ftsj3Q9DBE9 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ftsj3Q9DBE9 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ftsj3Q9DBE9 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ftsj3Q9DBE9 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ftsj3Q9DBE9 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ftsj3Q9DBE9 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ftsj3Q9DBE9 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ftsj3Q9DBE9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ftsj3Q9DBE9 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ftsj3Q9DBE9 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ftsj3Q9DBE9 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ftsj3Q9DBE9 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ftsj3Q9DBE9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ftsj3Q9DBE9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ftsj3Q9DBE9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ftsj3Q9DBE9 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ftsj3Q9DBE9 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ftsj3Q9DBE9 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ftsj3Q9DBE9 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ftsj3Q9DBE9 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ftsj3Q9DBE9 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ftsj3Q9DBE9 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ftsj3Q9DBE9 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ftsj3Q9DBE9 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ftsj3Q9DBE9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ftsj3Q9DBE9 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ftsj3Q9DBE9 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ftsj3Q9DBE9 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ftsj3Q9DBE9 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ftsj3Q9DBE9 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ftsj3Q9DBE9 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ftsj3Q9DBE9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ftsj3Q9DBE9 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ftsj3Q9DBE9 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ftsj3Q9DBE9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ftsj3Q9DBE9 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Ftsj3Q9DBE9 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ftsj3Q9DBE9 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ftsj3Q9DBE9 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms