Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smg9Q9DB90 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smg9Q9DB90 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smg9Q9DB90 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smg9Q9DB90 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smg9Q9DB90 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smg9Q9DB90 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smg9Q9DB90 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smg9Q9DB90 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smg9Q9DB90 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smg9Q9DB90 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smg9Q9DB90 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smg9Q9DB90 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smg9Q9DB90 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smg9Q9DB90 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smg9Q9DB90 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smg9Q9DB90 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smg9Q9DB90 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smg9Q9DB90 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smg9Q9DB90 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smg9Q9DB90 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smg9Q9DB90 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smg9Q9DB90 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smg9Q9DB90 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smg9Q9DB90 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smg9Q9DB90 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smg9Q9DB90 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Smg9Q9DB90 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Smg9Q9DB90 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smg9Q9DB90 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smg9Q9DB90 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smg9Q9DB90 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Smg9Q9DB90 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smg9Q9DB90 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smg9Q9DB90 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smg9Q9DB90 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smg9Q9DB90 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smg9Q9DB90 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smg9Q9DB90 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smg9Q9DB90 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smg9Q9DB90 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smg9Q9DB90 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smg9Q9DB90 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smg9Q9DB90 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smg9Q9DB90 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smg9Q9DB90 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smg9Q9DB90 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smg9Q9DB90 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smg9Q9DB90 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smg9Q9DB90 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Smg9Q9DB90 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smg9Q9DB90 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smg9Q9DB90 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smg9Q9DB90 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smg9Q9DB90 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smg9Q9DB90 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smg9Q9DB90 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Smg9Q9DB90 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Smg9Q9DB90 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smg9Q9DB90 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smg9Q9DB90 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smg9Q9DB90 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smg9Q9DB90 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smg9Q9DB90 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smg9Q9DB90 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smg9Q9DB90 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smg9Q9DB90 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Smg9Q9DB90 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smg9Q9DB90 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Smg9Q9DB90 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Smg9Q9DB90 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Smg9Q9DB90 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Smg9Q9DB90 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Smg9Q9DB90 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Smg9Q9DB90 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Smg9Q9DB90 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Smg9Q9DB90 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Smg9Q9DB90 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Smg9Q9DB90 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Smg9Q9DB90 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smg9Q9DB90 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smg9Q9DB90 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smg9Q9DB90 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smg9Q9DB90 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Smg9Q9DB90 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smg9Q9DB90 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Smg9Q9DB90 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smg9Q9DB90 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smg9Q9DB90 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smg9Q9DB90 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smg9Q9DB90 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smg9Q9DB90 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Smg9Q9DB90 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smg9Q9DB90 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smg9Q9DB90 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smg9Q9DB90 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smg9Q9DB90 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Smg9Q9DB90 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smg9Q9DB90 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Smg9Q9DB90 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
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