Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB70

Fundc1, FUN14 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fundc1Q9DB70 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fundc1Q9DB70 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fundc1Q9DB70 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fundc1Q9DB70 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Fundc1Q9DB70 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fundc1Q9DB70 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fundc1Q9DB70 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Fundc1Q9DB70 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Fundc1Q9DB70 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fundc1Q9DB70 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fundc1Q9DB70 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fundc1Q9DB70 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fundc1Q9DB70 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fundc1Q9DB70 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fundc1Q9DB70 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fundc1Q9DB70 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fundc1Q9DB70 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fundc1Q9DB70 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fundc1Q9DB70 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fundc1Q9DB70 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fundc1Q9DB70 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fundc1Q9DB70 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fundc1Q9DB70 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fundc1Q9DB70 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fundc1Q9DB70 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fundc1Q9DB70 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fundc1Q9DB70 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fundc1Q9DB70 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fundc1Q9DB70 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fundc1Q9DB70 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fundc1Q9DB70 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fundc1Q9DB70 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fundc1Q9DB70 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fundc1Q9DB70 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Fundc1Q9DB70 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fundc1Q9DB70 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fundc1Q9DB70 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fundc1Q9DB70 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fundc1Q9DB70 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fundc1Q9DB70 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fundc1Q9DB70 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fundc1Q9DB70 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fundc1Q9DB70 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fundc1Q9DB70 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fundc1Q9DB70 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fundc1Q9DB70 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fundc1Q9DB70 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fundc1Q9DB70 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fundc1Q9DB70 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fundc1Q9DB70 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Fundc1Q9DB70 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fundc1Q9DB70 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fundc1Q9DB70 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fundc1Q9DB70 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fundc1Q9DB70 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fundc1Q9DB70 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Fundc1Q9DB70 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fundc1Q9DB70 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fundc1Q9DB70 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fundc1Q9DB70 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Fundc1Q9DB70 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Fundc1Q9DB70 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Fundc1Q9DB70 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Fundc1Q9DB70 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Fundc1Q9DB70 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Fundc1Q9DB70 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Fundc1Q9DB70 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Fundc1Q9DB70 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fundc1Q9DB70 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fundc1Q9DB70 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Fundc1Q9DB70 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fundc1Q9DB70 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Fundc1Q9DB70 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fundc1Q9DB70 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Fundc1Q9DB70 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Fundc1Q9DB70 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Fundc1Q9DB70 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Fundc1Q9DB70 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fundc1Q9DB70 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fundc1Q9DB70 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fundc1Q9DB70 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Fundc1Q9DB70 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Fundc1Q9DB70 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Fundc1Q9DB70 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fundc1Q9DB70 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fundc1Q9DB70 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fundc1Q9DB70 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Fundc1Q9DB70 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fundc1Q9DB70 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fundc1Q9DB70 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fundc1Q9DB70 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fundc1Q9DB70 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fundc1Q9DB70 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fundc1Q9DB70 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fundc1Q9DB70 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fundc1Q9DB70 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Fundc1Q9DB70 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Fundc1Q9DB70 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Fundc1Q9DB70 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Fundc1Q9DB70 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms