Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB34

Chmp2a, Charged multivesicular body protein 2a, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp2aQ9DB34 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Chmp2aQ9DB34 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chmp2aQ9DB34 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chmp2aQ9DB34 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chmp2aQ9DB34 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chmp2aQ9DB34 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chmp2aQ9DB34 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chmp2aQ9DB34 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chmp2aQ9DB34 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Chmp2aQ9DB34 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chmp2aQ9DB34 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chmp2aQ9DB34 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chmp2aQ9DB34 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chmp2aQ9DB34 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chmp2aQ9DB34 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chmp2aQ9DB34 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Chmp2aQ9DB34 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Chmp2aQ9DB34 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Chmp2aQ9DB34 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Chmp2aQ9DB34 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Chmp2aQ9DB34 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Chmp2aQ9DB34 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Chmp2aQ9DB34 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Chmp2aQ9DB34 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Chmp2aQ9DB34 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Chmp2aQ9DB34 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Chmp2aQ9DB34 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Chmp2aQ9DB34 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Chmp2aQ9DB34 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chmp2aQ9DB34 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chmp2aQ9DB34 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chmp2aQ9DB34 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chmp2aQ9DB34 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Chmp2aQ9DB34 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Chmp2aQ9DB34 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Chmp2aQ9DB34 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Chmp2aQ9DB34 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Chmp2aQ9DB34 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Chmp2aQ9DB34 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Chmp2aQ9DB34 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Chmp2aQ9DB34 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Chmp2aQ9DB34 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Chmp2aQ9DB34 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Chmp2aQ9DB34 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Chmp2aQ9DB34 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Chmp2aQ9DB34 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Chmp2aQ9DB34 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Chmp2aQ9DB34 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chmp2aQ9DB34 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chmp2aQ9DB34 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Chmp2aQ9DB34 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Chmp2aQ9DB34 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chmp2aQ9DB34 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chmp2aQ9DB34 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chmp2aQ9DB34 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chmp2aQ9DB34 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chmp2aQ9DB34 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chmp2aQ9DB34 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chmp2aQ9DB34 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chmp2aQ9DB34 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chmp2aQ9DB34 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chmp2aQ9DB34 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chmp2aQ9DB34 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chmp2aQ9DB34 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Chmp2aQ9DB34 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Chmp2aQ9DB34 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chmp2aQ9DB34 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chmp2aQ9DB34 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chmp2aQ9DB34 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chmp2aQ9DB34 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chmp2aQ9DB34 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chmp2aQ9DB34 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chmp2aQ9DB34 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chmp2aQ9DB34 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Chmp2aQ9DB34 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chmp2aQ9DB34 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Chmp2aQ9DB34 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chmp2aQ9DB34 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chmp2aQ9DB34 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chmp2aQ9DB34 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chmp2aQ9DB34 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chmp2aQ9DB34 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chmp2aQ9DB34 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chmp2aQ9DB34 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chmp2aQ9DB34 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Chmp2aQ9DB34 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chmp2aQ9DB34 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chmp2aQ9DB34 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Chmp2aQ9DB34 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Chmp2aQ9DB34 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Chmp2aQ9DB34 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Chmp2aQ9DB34 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Chmp2aQ9DB34 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Chmp2aQ9DB34 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Chmp2aQ9DB34 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chmp2aQ9DB34 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chmp2aQ9DB34 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chmp2aQ9DB34 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chmp2aQ9DB34 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chmp2aQ9DB34 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms