Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAA3

Uncharacterized protein C4orf36 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9DAA3 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9DAA3 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9DAA3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9DAA3 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9DAA3 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9DAA3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9DAA3 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9DAA3 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9DAA3 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9DAA3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9DAA3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9DAA3 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9DAA3 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9DAA3 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9DAA3 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9DAA3 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9DAA3 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9DAA3 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9DAA3 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9DAA3 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9DAA3 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9DAA3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9DAA3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9DAA3 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9DAA3 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9DAA3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9DAA3 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9DAA3 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9DAA3 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9DAA3 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9DAA3 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9DAA3 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9DAA3 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9DAA3 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9DAA3 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9DAA3 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9DAA3 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9DAA3 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9DAA3 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9DAA3 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9DAA3 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9DAA3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9DAA3 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9DAA3 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9DAA3 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9DAA3 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9DAA3 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9DAA3 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9DAA3 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9DAA3 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9DAA3 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9DAA3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9DAA3 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9DAA3 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9DAA3 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9DAA3 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9DAA3 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9DAA3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9DAA3 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9DAA3 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9DAA3 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9DAA3 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9DAA3 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9DAA3 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9DAA3 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Q9DAA3 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9DAA3 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9DAA3 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9DAA3 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9DAA3 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9DAA3 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9DAA3 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9DAA3 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9DAA3 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9DAA3 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9DAA3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9DAA3 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9DAA3 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9DAA3 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9DAA3 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9DAA3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9DAA3 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9DAA3 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9DAA3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9DAA3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Q9DAA3 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9DAA3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9DAA3 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9DAA3 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9DAA3 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9DAA3 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9DAA3 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9DAA3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Q9DAA3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9DAA3 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9DAA3 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9DAA3 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9DAA3 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9DAA3 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Q9DAA3 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms