Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA21

Smco2, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco2Q9DA21 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Smco2Q9DA21 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Smco2Q9DA21 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Smco2Q9DA21 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Smco2Q9DA21 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Smco2Q9DA21 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Smco2Q9DA21 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Smco2Q9DA21 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Smco2Q9DA21 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Smco2Q9DA21 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Smco2Q9DA21 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Smco2Q9DA21 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Smco2Q9DA21 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Smco2Q9DA21 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Smco2Q9DA21 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Smco2Q9DA21 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Smco2Q9DA21 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Smco2Q9DA21 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Smco2Q9DA21 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Smco2Q9DA21 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Smco2Q9DA21 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Smco2Q9DA21 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Smco2Q9DA21 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Smco2Q9DA21 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Smco2Q9DA21 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Smco2Q9DA21 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Smco2Q9DA21 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Smco2Q9DA21 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Smco2Q9DA21 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Smco2Q9DA21 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Smco2Q9DA21 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Smco2Q9DA21 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Smco2Q9DA21 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Smco2Q9DA21 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Smco2Q9DA21 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Smco2Q9DA21 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Smco2Q9DA21 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Smco2Q9DA21 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Smco2Q9DA21 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Smco2Q9DA21 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Smco2Q9DA21 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Smco2Q9DA21 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Smco2Q9DA21 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Smco2Q9DA21 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Smco2Q9DA21 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Smco2Q9DA21 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Smco2Q9DA21 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Smco2Q9DA21 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Smco2Q9DA21 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Smco2Q9DA21 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Smco2Q9DA21 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Smco2Q9DA21 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Smco2Q9DA21 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Smco2Q9DA21 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Smco2Q9DA21 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Smco2Q9DA21 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Smco2Q9DA21 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Smco2Q9DA21 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Smco2Q9DA21 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Smco2Q9DA21 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Smco2Q9DA21 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Smco2Q9DA21 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Smco2Q9DA21 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Smco2Q9DA21 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Smco2Q9DA21 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Smco2Q9DA21 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Smco2Q9DA21 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Smco2Q9DA21 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Smco2Q9DA21 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Smco2Q9DA21 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Smco2Q9DA21 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Smco2Q9DA21 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Smco2Q9DA21 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Smco2Q9DA21 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Smco2Q9DA21 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Smco2Q9DA21 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Smco2Q9DA21 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Smco2Q9DA21 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Smco2Q9DA21 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Smco2Q9DA21 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Smco2Q9DA21 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Smco2Q9DA21 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Smco2Q9DA21 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Smco2Q9DA21 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Smco2Q9DA21 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Smco2Q9DA21 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Smco2Q9DA21 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Smco2Q9DA21 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Smco2Q9DA21 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Smco2Q9DA21 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Smco2Q9DA21 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Smco2Q9DA21 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Smco2Q9DA21 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Smco2Q9DA21 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Smco2Q9DA21 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Smco2Q9DA21 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Smco2Q9DA21 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Smco2Q9DA21 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Smco2Q9DA21 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Smco2Q9DA21 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms