Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9J3

Actrt1, Actin-related protein T1, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actrt1Q9D9J3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Actrt1Q9D9J3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Actrt1Q9D9J3 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Actrt1Q9D9J3 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Actrt1Q9D9J3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Actrt1Q9D9J3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Actrt1Q9D9J3 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Actrt1Q9D9J3 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Actrt1Q9D9J3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Actrt1Q9D9J3 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Actrt1Q9D9J3 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Actrt1Q9D9J3 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Actrt1Q9D9J3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Actrt1Q9D9J3 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Actrt1Q9D9J3 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Actrt1Q9D9J3 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Actrt1Q9D9J3 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Actrt1Q9D9J3 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Actrt1Q9D9J3 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Actrt1Q9D9J3 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Actrt1Q9D9J3 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Actrt1Q9D9J3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Actrt1Q9D9J3 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Actrt1Q9D9J3 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Actrt1Q9D9J3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Actrt1Q9D9J3 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Actrt1Q9D9J3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Actrt1Q9D9J3 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Actrt1Q9D9J3 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Actrt1Q9D9J3 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Actrt1Q9D9J3 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Actrt1Q9D9J3 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Actrt1Q9D9J3 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Actrt1Q9D9J3 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Actrt1Q9D9J3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Actrt1Q9D9J3 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Actrt1Q9D9J3 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Actrt1Q9D9J3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Actrt1Q9D9J3 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Actrt1Q9D9J3 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Actrt1Q9D9J3 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Actrt1Q9D9J3 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Actrt1Q9D9J3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Actrt1Q9D9J3 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Actrt1Q9D9J3 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Actrt1Q9D9J3 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Actrt1Q9D9J3 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Actrt1Q9D9J3 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Actrt1Q9D9J3 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Actrt1Q9D9J3 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Actrt1Q9D9J3 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Actrt1Q9D9J3 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Actrt1Q9D9J3 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Actrt1Q9D9J3 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Actrt1Q9D9J3 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Actrt1Q9D9J3 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Actrt1Q9D9J3 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Actrt1Q9D9J3 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Actrt1Q9D9J3 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Actrt1Q9D9J3 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Actrt1Q9D9J3 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Actrt1Q9D9J3 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Actrt1Q9D9J3 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Actrt1Q9D9J3 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Actrt1Q9D9J3 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Actrt1Q9D9J3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Actrt1Q9D9J3 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Actrt1Q9D9J3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Actrt1Q9D9J3 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Actrt1Q9D9J3 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Actrt1Q9D9J3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Actrt1Q9D9J3 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Actrt1Q9D9J3 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Actrt1Q9D9J3 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Actrt1Q9D9J3 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Actrt1Q9D9J3 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Actrt1Q9D9J3 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Actrt1Q9D9J3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Actrt1Q9D9J3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Actrt1Q9D9J3 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Actrt1Q9D9J3 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Actrt1Q9D9J3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Actrt1Q9D9J3 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Actrt1Q9D9J3 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Actrt1Q9D9J3 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Actrt1Q9D9J3 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Actrt1Q9D9J3 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Actrt1Q9D9J3 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Actrt1Q9D9J3 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Actrt1Q9D9J3 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Actrt1Q9D9J3 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Actrt1Q9D9J3 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Actrt1Q9D9J3 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Actrt1Q9D9J3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Actrt1Q9D9J3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Actrt1Q9D9J3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Actrt1Q9D9J3 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Actrt1Q9D9J3 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Actrt1Q9D9J3 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Actrt1Q9D9J3 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 130.4 ms