Protein–RNA interactions for Protein: Q9D991

1700123K08Rik, RIKEN cDNA 1700123K08 gene, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700123K08RikQ9D991 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
1700123K08RikQ9D991 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
1700123K08RikQ9D991 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
1700123K08RikQ9D991 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
1700123K08RikQ9D991 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
1700123K08RikQ9D991 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
1700123K08RikQ9D991 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
1700123K08RikQ9D991 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
1700123K08RikQ9D991 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
1700123K08RikQ9D991 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
1700123K08RikQ9D991 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
1700123K08RikQ9D991 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
1700123K08RikQ9D991 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
1700123K08RikQ9D991 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
1700123K08RikQ9D991 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
1700123K08RikQ9D991 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
1700123K08RikQ9D991 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
1700123K08RikQ9D991 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
1700123K08RikQ9D991 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
1700123K08RikQ9D991 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
1700123K08RikQ9D991 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
1700123K08RikQ9D991 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
1700123K08RikQ9D991 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
1700123K08RikQ9D991 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
1700123K08RikQ9D991 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
1700123K08RikQ9D991 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
1700123K08RikQ9D991 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
1700123K08RikQ9D991 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
1700123K08RikQ9D991 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
1700123K08RikQ9D991 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
1700123K08RikQ9D991 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
1700123K08RikQ9D991 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
1700123K08RikQ9D991 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
1700123K08RikQ9D991 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
1700123K08RikQ9D991 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
1700123K08RikQ9D991 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
1700123K08RikQ9D991 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
1700123K08RikQ9D991 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
1700123K08RikQ9D991 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
1700123K08RikQ9D991 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
1700123K08RikQ9D991 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
1700123K08RikQ9D991 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
1700123K08RikQ9D991 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
1700123K08RikQ9D991 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
1700123K08RikQ9D991 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
1700123K08RikQ9D991 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
1700123K08RikQ9D991 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
1700123K08RikQ9D991 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
1700123K08RikQ9D991 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
1700123K08RikQ9D991 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
1700123K08RikQ9D991 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
1700123K08RikQ9D991 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
1700123K08RikQ9D991 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
1700123K08RikQ9D991 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
1700123K08RikQ9D991 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
1700123K08RikQ9D991 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
1700123K08RikQ9D991 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
1700123K08RikQ9D991 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
1700123K08RikQ9D991 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
1700123K08RikQ9D991 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
1700123K08RikQ9D991 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
1700123K08RikQ9D991 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
1700123K08RikQ9D991 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
1700123K08RikQ9D991 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
1700123K08RikQ9D991 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
1700123K08RikQ9D991 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
1700123K08RikQ9D991 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
1700123K08RikQ9D991 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
1700123K08RikQ9D991 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
1700123K08RikQ9D991 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
1700123K08RikQ9D991 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
1700123K08RikQ9D991 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
1700123K08RikQ9D991 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
1700123K08RikQ9D991 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
1700123K08RikQ9D991 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
1700123K08RikQ9D991 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
1700123K08RikQ9D991 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
1700123K08RikQ9D991 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
1700123K08RikQ9D991 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
1700123K08RikQ9D991 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
1700123K08RikQ9D991 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
1700123K08RikQ9D991 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
1700123K08RikQ9D991 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
1700123K08RikQ9D991 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
1700123K08RikQ9D991 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
1700123K08RikQ9D991 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
1700123K08RikQ9D991 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
1700123K08RikQ9D991 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
1700123K08RikQ9D991 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
1700123K08RikQ9D991 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
1700123K08RikQ9D991 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
1700123K08RikQ9D991 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
1700123K08RikQ9D991 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
1700123K08RikQ9D991 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
1700123K08RikQ9D991 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
1700123K08RikQ9D991 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
1700123K08RikQ9D991 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
1700123K08RikQ9D991 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
1700123K08RikQ9D991 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
1700123K08RikQ9D991 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.8 ms