Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8D0

Tnfrsf13c, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13C, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfrsf13cQ9D8D0 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfrsf13cQ9D8D0 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfrsf13cQ9D8D0 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfrsf13cQ9D8D0 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfrsf13cQ9D8D0 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfrsf13cQ9D8D0 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfrsf13cQ9D8D0 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfrsf13cQ9D8D0 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfrsf13cQ9D8D0 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tnfrsf13cQ9D8D0 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfrsf13cQ9D8D0 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfrsf13cQ9D8D0 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfrsf13cQ9D8D0 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tnfrsf13cQ9D8D0 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfrsf13cQ9D8D0 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfrsf13cQ9D8D0 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms