Protein–RNA interactions for Protein: Q9D883

U2af1, Splicing factor U2AF 35 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af1Q9D883 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
U2af1Q9D883 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
U2af1Q9D883 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
U2af1Q9D883 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
U2af1Q9D883 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
U2af1Q9D883 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
U2af1Q9D883 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
U2af1Q9D883 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
U2af1Q9D883 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
U2af1Q9D883 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
U2af1Q9D883 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
U2af1Q9D883 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
U2af1Q9D883 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
U2af1Q9D883 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
U2af1Q9D883 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
U2af1Q9D883 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
U2af1Q9D883 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
U2af1Q9D883 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
U2af1Q9D883 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
U2af1Q9D883 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
U2af1Q9D883 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
U2af1Q9D883 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
U2af1Q9D883 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
U2af1Q9D883 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
U2af1Q9D883 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
U2af1Q9D883 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
U2af1Q9D883 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
U2af1Q9D883 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
U2af1Q9D883 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
U2af1Q9D883 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
U2af1Q9D883 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
U2af1Q9D883 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
U2af1Q9D883 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
U2af1Q9D883 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
U2af1Q9D883 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
U2af1Q9D883 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
U2af1Q9D883 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
U2af1Q9D883 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
U2af1Q9D883 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
U2af1Q9D883 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
U2af1Q9D883 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
U2af1Q9D883 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
U2af1Q9D883 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
U2af1Q9D883 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
U2af1Q9D883 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
U2af1Q9D883 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
U2af1Q9D883 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
U2af1Q9D883 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
U2af1Q9D883 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
U2af1Q9D883 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
U2af1Q9D883 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
U2af1Q9D883 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
U2af1Q9D883 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
U2af1Q9D883 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
U2af1Q9D883 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
U2af1Q9D883 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.05
U2af1Q9D883 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
U2af1Q9D883 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
U2af1Q9D883 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
U2af1Q9D883 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
U2af1Q9D883 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
U2af1Q9D883 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
U2af1Q9D883 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
U2af1Q9D883 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
U2af1Q9D883 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
U2af1Q9D883 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
U2af1Q9D883 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
U2af1Q9D883 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
U2af1Q9D883 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
U2af1Q9D883 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
U2af1Q9D883 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
U2af1Q9D883 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
U2af1Q9D883 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
U2af1Q9D883 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
U2af1Q9D883 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
U2af1Q9D883 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
U2af1Q9D883 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
U2af1Q9D883 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
U2af1Q9D883 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
U2af1Q9D883 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
U2af1Q9D883 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
U2af1Q9D883 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
U2af1Q9D883 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
U2af1Q9D883 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
U2af1Q9D883 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
U2af1Q9D883 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
U2af1Q9D883 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
U2af1Q9D883 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
U2af1Q9D883 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
U2af1Q9D883 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
U2af1Q9D883 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
U2af1Q9D883 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
U2af1Q9D883 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
U2af1Q9D883 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
U2af1Q9D883 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
U2af1Q9D883 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
U2af1Q9D883 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
U2af1Q9D883 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
U2af1Q9D883 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
U2af1Q9D883 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms