Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7F7

Chmp4c, Charged multivesicular body protein 4c, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4cQ9D7F7 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Chmp4cQ9D7F7 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Chmp4cQ9D7F7 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Chmp4cQ9D7F7 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Chmp4cQ9D7F7 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Chmp4cQ9D7F7 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Chmp4cQ9D7F7 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Chmp4cQ9D7F7 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Chmp4cQ9D7F7 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Chmp4cQ9D7F7 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Chmp4cQ9D7F7 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Chmp4cQ9D7F7 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Chmp4cQ9D7F7 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Chmp4cQ9D7F7 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Chmp4cQ9D7F7 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Chmp4cQ9D7F7 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Chmp4cQ9D7F7 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Chmp4cQ9D7F7 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Chmp4cQ9D7F7 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Chmp4cQ9D7F7 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Chmp4cQ9D7F7 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Chmp4cQ9D7F7 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Chmp4cQ9D7F7 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Chmp4cQ9D7F7 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Chmp4cQ9D7F7 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Chmp4cQ9D7F7 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Chmp4cQ9D7F7 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Chmp4cQ9D7F7 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Chmp4cQ9D7F7 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Chmp4cQ9D7F7 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Chmp4cQ9D7F7 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Chmp4cQ9D7F7 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Chmp4cQ9D7F7 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Chmp4cQ9D7F7 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Chmp4cQ9D7F7 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Chmp4cQ9D7F7 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Chmp4cQ9D7F7 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Chmp4cQ9D7F7 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Chmp4cQ9D7F7 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Chmp4cQ9D7F7 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Chmp4cQ9D7F7 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Chmp4cQ9D7F7 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Chmp4cQ9D7F7 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Chmp4cQ9D7F7 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Chmp4cQ9D7F7 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Chmp4cQ9D7F7 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Chmp4cQ9D7F7 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Chmp4cQ9D7F7 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Chmp4cQ9D7F7 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Chmp4cQ9D7F7 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Chmp4cQ9D7F7 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Chmp4cQ9D7F7 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Chmp4cQ9D7F7 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Chmp4cQ9D7F7 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Chmp4cQ9D7F7 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Chmp4cQ9D7F7 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Chmp4cQ9D7F7 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Chmp4cQ9D7F7 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Chmp4cQ9D7F7 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Chmp4cQ9D7F7 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Chmp4cQ9D7F7 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Chmp4cQ9D7F7 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Chmp4cQ9D7F7 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Chmp4cQ9D7F7 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Chmp4cQ9D7F7 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Chmp4cQ9D7F7 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Chmp4cQ9D7F7 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Chmp4cQ9D7F7 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Chmp4cQ9D7F7 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Chmp4cQ9D7F7 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Chmp4cQ9D7F7 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Chmp4cQ9D7F7 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Chmp4cQ9D7F7 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Chmp4cQ9D7F7 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Chmp4cQ9D7F7 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Chmp4cQ9D7F7 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Chmp4cQ9D7F7 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Chmp4cQ9D7F7 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Chmp4cQ9D7F7 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Chmp4cQ9D7F7 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Chmp4cQ9D7F7 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Chmp4cQ9D7F7 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Chmp4cQ9D7F7 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Chmp4cQ9D7F7 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Chmp4cQ9D7F7 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Chmp4cQ9D7F7 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Chmp4cQ9D7F7 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Chmp4cQ9D7F7 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Chmp4cQ9D7F7 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Chmp4cQ9D7F7 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Chmp4cQ9D7F7 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Chmp4cQ9D7F7 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Chmp4cQ9D7F7 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Chmp4cQ9D7F7 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Chmp4cQ9D7F7 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Chmp4cQ9D7F7 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Chmp4cQ9D7F7 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Chmp4cQ9D7F7 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Chmp4cQ9D7F7 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Chmp4cQ9D7F7 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms