Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D7

Cldn23, Claudin-23, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn23Q9D7D7 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cldn23Q9D7D7 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cldn23Q9D7D7 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cldn23Q9D7D7 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cldn23Q9D7D7 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Cldn23Q9D7D7 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cldn23Q9D7D7 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cldn23Q9D7D7 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cldn23Q9D7D7 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cldn23Q9D7D7 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cldn23Q9D7D7 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cldn23Q9D7D7 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cldn23Q9D7D7 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cldn23Q9D7D7 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cldn23Q9D7D7 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cldn23Q9D7D7 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cldn23Q9D7D7 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cldn23Q9D7D7 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cldn23Q9D7D7 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cldn23Q9D7D7 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cldn23Q9D7D7 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cldn23Q9D7D7 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cldn23Q9D7D7 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cldn23Q9D7D7 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cldn23Q9D7D7 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cldn23Q9D7D7 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cldn23Q9D7D7 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cldn23Q9D7D7 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cldn23Q9D7D7 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Cldn23Q9D7D7 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cldn23Q9D7D7 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cldn23Q9D7D7 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cldn23Q9D7D7 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cldn23Q9D7D7 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cldn23Q9D7D7 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cldn23Q9D7D7 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cldn23Q9D7D7 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cldn23Q9D7D7 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cldn23Q9D7D7 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cldn23Q9D7D7 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cldn23Q9D7D7 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cldn23Q9D7D7 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cldn23Q9D7D7 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cldn23Q9D7D7 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cldn23Q9D7D7 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cldn23Q9D7D7 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cldn23Q9D7D7 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cldn23Q9D7D7 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cldn23Q9D7D7 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cldn23Q9D7D7 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cldn23Q9D7D7 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cldn23Q9D7D7 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cldn23Q9D7D7 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cldn23Q9D7D7 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cldn23Q9D7D7 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cldn23Q9D7D7 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Cldn23Q9D7D7 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cldn23Q9D7D7 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cldn23Q9D7D7 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cldn23Q9D7D7 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cldn23Q9D7D7 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cldn23Q9D7D7 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cldn23Q9D7D7 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cldn23Q9D7D7 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cldn23Q9D7D7 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cldn23Q9D7D7 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cldn23Q9D7D7 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cldn23Q9D7D7 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cldn23Q9D7D7 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cldn23Q9D7D7 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cldn23Q9D7D7 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cldn23Q9D7D7 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cldn23Q9D7D7 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cldn23Q9D7D7 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cldn23Q9D7D7 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cldn23Q9D7D7 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cldn23Q9D7D7 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cldn23Q9D7D7 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cldn23Q9D7D7 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cldn23Q9D7D7 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cldn23Q9D7D7 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cldn23Q9D7D7 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cldn23Q9D7D7 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cldn23Q9D7D7 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cldn23Q9D7D7 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cldn23Q9D7D7 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cldn23Q9D7D7 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cldn23Q9D7D7 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cldn23Q9D7D7 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cldn23Q9D7D7 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cldn23Q9D7D7 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cldn23Q9D7D7 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cldn23Q9D7D7 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cldn23Q9D7D7 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cldn23Q9D7D7 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Cldn23Q9D7D7 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cldn23Q9D7D7 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cldn23Q9D7D7 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cldn23Q9D7D7 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cldn23Q9D7D7 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
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