Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6E4

Ttc9b, Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9bQ9D6E4 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ttc9bQ9D6E4 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ttc9bQ9D6E4 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ttc9bQ9D6E4 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ttc9bQ9D6E4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ttc9bQ9D6E4 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ttc9bQ9D6E4 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Ttc9bQ9D6E4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ttc9bQ9D6E4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ttc9bQ9D6E4 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ttc9bQ9D6E4 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ttc9bQ9D6E4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ttc9bQ9D6E4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ttc9bQ9D6E4 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ttc9bQ9D6E4 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ttc9bQ9D6E4 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ttc9bQ9D6E4 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ttc9bQ9D6E4 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ttc9bQ9D6E4 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Ttc9bQ9D6E4 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ttc9bQ9D6E4 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Ttc9bQ9D6E4 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ttc9bQ9D6E4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ttc9bQ9D6E4 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ttc9bQ9D6E4 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ttc9bQ9D6E4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ttc9bQ9D6E4 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ttc9bQ9D6E4 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ttc9bQ9D6E4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ttc9bQ9D6E4 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ttc9bQ9D6E4 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ttc9bQ9D6E4 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ttc9bQ9D6E4 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Ttc9bQ9D6E4 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Ttc9bQ9D6E4 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ttc9bQ9D6E4 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ttc9bQ9D6E4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ttc9bQ9D6E4 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ttc9bQ9D6E4 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Ttc9bQ9D6E4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ttc9bQ9D6E4 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ttc9bQ9D6E4 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ttc9bQ9D6E4 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ttc9bQ9D6E4 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ttc9bQ9D6E4 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ttc9bQ9D6E4 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ttc9bQ9D6E4 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ttc9bQ9D6E4 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ttc9bQ9D6E4 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ttc9bQ9D6E4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ttc9bQ9D6E4 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ttc9bQ9D6E4 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ttc9bQ9D6E4 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ttc9bQ9D6E4 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ttc9bQ9D6E4 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Ttc9bQ9D6E4 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Ttc9bQ9D6E4 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ttc9bQ9D6E4 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ttc9bQ9D6E4 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ttc9bQ9D6E4 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ttc9bQ9D6E4 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ttc9bQ9D6E4 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ttc9bQ9D6E4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ttc9bQ9D6E4 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ttc9bQ9D6E4 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ttc9bQ9D6E4 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Ttc9bQ9D6E4 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ttc9bQ9D6E4 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ttc9bQ9D6E4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ttc9bQ9D6E4 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ttc9bQ9D6E4 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ttc9bQ9D6E4 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ttc9bQ9D6E4 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ttc9bQ9D6E4 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ttc9bQ9D6E4 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ttc9bQ9D6E4 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ttc9bQ9D6E4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ttc9bQ9D6E4 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ttc9bQ9D6E4 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ttc9bQ9D6E4 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ttc9bQ9D6E4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ttc9bQ9D6E4 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ttc9bQ9D6E4 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ttc9bQ9D6E4 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ttc9bQ9D6E4 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ttc9bQ9D6E4 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ttc9bQ9D6E4 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ttc9bQ9D6E4 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ttc9bQ9D6E4 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ttc9bQ9D6E4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ttc9bQ9D6E4 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ttc9bQ9D6E4 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Ttc9bQ9D6E4 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ttc9bQ9D6E4 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ttc9bQ9D6E4 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ttc9bQ9D6E4 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ttc9bQ9D6E4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ttc9bQ9D6E4 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ttc9bQ9D6E4 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ttc9bQ9D6E4 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms