Protein–RNA interactions for Protein: Q9D541

Ccdc7, Coiled-coil domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7Q9D541 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc7Q9D541 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc7Q9D541 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc7Q9D541 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc7Q9D541 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc7Q9D541 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc7Q9D541 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc7Q9D541 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc7Q9D541 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc7Q9D541 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc7Q9D541 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc7Q9D541 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc7Q9D541 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc7Q9D541 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc7Q9D541 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ccdc7Q9D541 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc7Q9D541 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc7Q9D541 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc7Q9D541 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc7Q9D541 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc7Q9D541 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc7Q9D541 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc7Q9D541 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc7Q9D541 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc7Q9D541 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc7Q9D541 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc7Q9D541 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc7Q9D541 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc7Q9D541 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc7Q9D541 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc7Q9D541 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc7Q9D541 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc7Q9D541 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc7Q9D541 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc7Q9D541 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc7Q9D541 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc7Q9D541 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc7Q9D541 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc7Q9D541 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc7Q9D541 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc7Q9D541 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc7Q9D541 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc7Q9D541 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc7Q9D541 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc7Q9D541 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc7Q9D541 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc7Q9D541 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc7Q9D541 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc7Q9D541 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc7Q9D541 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc7Q9D541 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc7Q9D541 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc7Q9D541 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc7Q9D541 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc7Q9D541 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc7Q9D541 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc7Q9D541 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc7Q9D541 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc7Q9D541 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc7Q9D541 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc7Q9D541 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc7Q9D541 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc7Q9D541 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc7Q9D541 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc7Q9D541 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc7Q9D541 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc7Q9D541 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc7Q9D541 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc7Q9D541 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc7Q9D541 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc7Q9D541 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc7Q9D541 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc7Q9D541 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc7Q9D541 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc7Q9D541 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc7Q9D541 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc7Q9D541 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc7Q9D541 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc7Q9D541 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc7Q9D541 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc7Q9D541 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc7Q9D541 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc7Q9D541 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc7Q9D541 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc7Q9D541 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc7Q9D541 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc7Q9D541 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc7Q9D541 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc7Q9D541 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc7Q9D541 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc7Q9D541 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc7Q9D541 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc7Q9D541 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc7Q9D541 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc7Q9D541 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc7Q9D541 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc7Q9D541 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc7Q9D541 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc7Q9D541 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc7Q9D541 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms