Protein–RNA interactions for Protein: Q9D516

Ccdc130, Coiled-coil domain-containing protein 130, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc130Q9D516 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc130Q9D516 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccdc130Q9D516 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc130Q9D516 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc130Q9D516 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc130Q9D516 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc130Q9D516 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc130Q9D516 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc130Q9D516 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc130Q9D516 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc130Q9D516 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc130Q9D516 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc130Q9D516 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc130Q9D516 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc130Q9D516 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc130Q9D516 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc130Q9D516 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc130Q9D516 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc130Q9D516 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc130Q9D516 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc130Q9D516 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc130Q9D516 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc130Q9D516 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc130Q9D516 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc130Q9D516 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc130Q9D516 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc130Q9D516 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc130Q9D516 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc130Q9D516 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc130Q9D516 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc130Q9D516 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc130Q9D516 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc130Q9D516 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc130Q9D516 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc130Q9D516 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc130Q9D516 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc130Q9D516 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc130Q9D516 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc130Q9D516 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc130Q9D516 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc130Q9D516 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc130Q9D516 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc130Q9D516 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc130Q9D516 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc130Q9D516 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc130Q9D516 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc130Q9D516 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc130Q9D516 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc130Q9D516 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc130Q9D516 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc130Q9D516 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc130Q9D516 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc130Q9D516 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc130Q9D516 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc130Q9D516 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc130Q9D516 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc130Q9D516 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc130Q9D516 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc130Q9D516 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc130Q9D516 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc130Q9D516 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc130Q9D516 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc130Q9D516 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc130Q9D516 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc130Q9D516 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc130Q9D516 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc130Q9D516 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc130Q9D516 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc130Q9D516 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc130Q9D516 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc130Q9D516 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc130Q9D516 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc130Q9D516 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc130Q9D516 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc130Q9D516 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc130Q9D516 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc130Q9D516 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc130Q9D516 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc130Q9D516 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc130Q9D516 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc130Q9D516 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc130Q9D516 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc130Q9D516 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc130Q9D516 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc130Q9D516 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc130Q9D516 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc130Q9D516 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc130Q9D516 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc130Q9D516 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc130Q9D516 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc130Q9D516 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc130Q9D516 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc130Q9D516 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc130Q9D516 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc130Q9D516 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc130Q9D516 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc130Q9D516 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc130Q9D516 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc130Q9D516 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc130Q9D516 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms