Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Z5

Prame, Preferentially-expressed antigen in melanoma, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrameQ9D4Z5 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PrameQ9D4Z5 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PrameQ9D4Z5 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PrameQ9D4Z5 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PrameQ9D4Z5 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PrameQ9D4Z5 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PrameQ9D4Z5 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PrameQ9D4Z5 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PrameQ9D4Z5 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PrameQ9D4Z5 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PrameQ9D4Z5 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PrameQ9D4Z5 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PrameQ9D4Z5 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PrameQ9D4Z5 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PrameQ9D4Z5 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PrameQ9D4Z5 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PrameQ9D4Z5 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PrameQ9D4Z5 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PrameQ9D4Z5 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PrameQ9D4Z5 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PrameQ9D4Z5 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PrameQ9D4Z5 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PrameQ9D4Z5 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PrameQ9D4Z5 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PrameQ9D4Z5 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PrameQ9D4Z5 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PrameQ9D4Z5 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PrameQ9D4Z5 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PrameQ9D4Z5 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PrameQ9D4Z5 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PrameQ9D4Z5 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PrameQ9D4Z5 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PrameQ9D4Z5 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PrameQ9D4Z5 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PrameQ9D4Z5 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PrameQ9D4Z5 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PrameQ9D4Z5 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PrameQ9D4Z5 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PrameQ9D4Z5 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PrameQ9D4Z5 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PrameQ9D4Z5 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PrameQ9D4Z5 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PrameQ9D4Z5 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PrameQ9D4Z5 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PrameQ9D4Z5 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PrameQ9D4Z5 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PrameQ9D4Z5 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PrameQ9D4Z5 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PrameQ9D4Z5 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PrameQ9D4Z5 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PrameQ9D4Z5 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PrameQ9D4Z5 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PrameQ9D4Z5 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PrameQ9D4Z5 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PrameQ9D4Z5 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PrameQ9D4Z5 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PrameQ9D4Z5 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PrameQ9D4Z5 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PrameQ9D4Z5 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PrameQ9D4Z5 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PrameQ9D4Z5 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PrameQ9D4Z5 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PrameQ9D4Z5 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PrameQ9D4Z5 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PrameQ9D4Z5 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PrameQ9D4Z5 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PrameQ9D4Z5 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PrameQ9D4Z5 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PrameQ9D4Z5 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PrameQ9D4Z5 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PrameQ9D4Z5 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PrameQ9D4Z5 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PrameQ9D4Z5 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PrameQ9D4Z5 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PrameQ9D4Z5 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PrameQ9D4Z5 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PrameQ9D4Z5 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PrameQ9D4Z5 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PrameQ9D4Z5 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PrameQ9D4Z5 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PrameQ9D4Z5 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PrameQ9D4Z5 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PrameQ9D4Z5 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PrameQ9D4Z5 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PrameQ9D4Z5 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PrameQ9D4Z5 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PrameQ9D4Z5 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PrameQ9D4Z5 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PrameQ9D4Z5 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PrameQ9D4Z5 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PrameQ9D4Z5 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PrameQ9D4Z5 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PrameQ9D4Z5 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PrameQ9D4Z5 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PrameQ9D4Z5 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PrameQ9D4Z5 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PrameQ9D4Z5 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PrameQ9D4Z5 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PrameQ9D4Z5 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PrameQ9D4Z5 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms