Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4U4

H2al3, H2A histone family member L3, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al3Q9D4U4 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2al3Q9D4U4 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2al3Q9D4U4 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2al3Q9D4U4 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2al3Q9D4U4 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2al3Q9D4U4 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2al3Q9D4U4 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2al3Q9D4U4 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2al3Q9D4U4 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
H2al3Q9D4U4 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2al3Q9D4U4 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2al3Q9D4U4 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2al3Q9D4U4 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2al3Q9D4U4 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2al3Q9D4U4 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2al3Q9D4U4 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2al3Q9D4U4 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2al3Q9D4U4 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2al3Q9D4U4 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2al3Q9D4U4 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2al3Q9D4U4 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2al3Q9D4U4 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2al3Q9D4U4 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2al3Q9D4U4 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2al3Q9D4U4 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2al3Q9D4U4 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2al3Q9D4U4 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2al3Q9D4U4 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2al3Q9D4U4 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2al3Q9D4U4 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2al3Q9D4U4 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2al3Q9D4U4 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2al3Q9D4U4 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2al3Q9D4U4 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2al3Q9D4U4 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
H2al3Q9D4U4 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2al3Q9D4U4 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2al3Q9D4U4 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2al3Q9D4U4 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2al3Q9D4U4 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2al3Q9D4U4 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2al3Q9D4U4 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2al3Q9D4U4 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2al3Q9D4U4 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2al3Q9D4U4 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2al3Q9D4U4 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2al3Q9D4U4 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2al3Q9D4U4 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2al3Q9D4U4 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2al3Q9D4U4 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
H2al3Q9D4U4 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2al3Q9D4U4 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2al3Q9D4U4 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2al3Q9D4U4 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2al3Q9D4U4 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2al3Q9D4U4 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2al3Q9D4U4 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2al3Q9D4U4 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2al3Q9D4U4 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
H2al3Q9D4U4 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2al3Q9D4U4 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2al3Q9D4U4 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2al3Q9D4U4 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2al3Q9D4U4 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2al3Q9D4U4 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2al3Q9D4U4 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2al3Q9D4U4 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2al3Q9D4U4 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2al3Q9D4U4 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2al3Q9D4U4 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2al3Q9D4U4 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2al3Q9D4U4 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2al3Q9D4U4 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2al3Q9D4U4 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2al3Q9D4U4 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
H2al3Q9D4U4 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2al3Q9D4U4 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2al3Q9D4U4 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2al3Q9D4U4 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2al3Q9D4U4 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2al3Q9D4U4 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2al3Q9D4U4 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2al3Q9D4U4 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2al3Q9D4U4 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2al3Q9D4U4 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2al3Q9D4U4 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2al3Q9D4U4 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2al3Q9D4U4 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2al3Q9D4U4 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2al3Q9D4U4 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
H2al3Q9D4U4 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2al3Q9D4U4 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2al3Q9D4U4 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2al3Q9D4U4 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2al3Q9D4U4 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2al3Q9D4U4 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2al3Q9D4U4 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
H2al3Q9D4U4 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2al3Q9D4U4 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
H2al3Q9D4U4 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms