Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J7

Phf6, PHD finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf6Q9D4J7 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Phf6Q9D4J7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Phf6Q9D4J7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Phf6Q9D4J7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Phf6Q9D4J7 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Phf6Q9D4J7 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Phf6Q9D4J7 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Phf6Q9D4J7 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Phf6Q9D4J7 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Phf6Q9D4J7 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Phf6Q9D4J7 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Phf6Q9D4J7 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Phf6Q9D4J7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Phf6Q9D4J7 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Phf6Q9D4J7 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Phf6Q9D4J7 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Phf6Q9D4J7 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Phf6Q9D4J7 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Phf6Q9D4J7 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Phf6Q9D4J7 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Phf6Q9D4J7 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Phf6Q9D4J7 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Phf6Q9D4J7 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Phf6Q9D4J7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Phf6Q9D4J7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Phf6Q9D4J7 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Phf6Q9D4J7 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Phf6Q9D4J7 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Phf6Q9D4J7 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Phf6Q9D4J7 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Phf6Q9D4J7 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Phf6Q9D4J7 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Phf6Q9D4J7 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Phf6Q9D4J7 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Phf6Q9D4J7 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Phf6Q9D4J7 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Phf6Q9D4J7 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Phf6Q9D4J7 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Phf6Q9D4J7 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Phf6Q9D4J7 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Phf6Q9D4J7 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Phf6Q9D4J7 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Phf6Q9D4J7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Phf6Q9D4J7 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Phf6Q9D4J7 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Phf6Q9D4J7 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Phf6Q9D4J7 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Phf6Q9D4J7 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Phf6Q9D4J7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Phf6Q9D4J7 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Phf6Q9D4J7 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Phf6Q9D4J7 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
Phf6Q9D4J7 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Phf6Q9D4J7 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Phf6Q9D4J7 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Phf6Q9D4J7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Phf6Q9D4J7 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Phf6Q9D4J7 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Phf6Q9D4J7 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Phf6Q9D4J7 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Phf6Q9D4J7 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Phf6Q9D4J7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Phf6Q9D4J7 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Phf6Q9D4J7 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Phf6Q9D4J7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Phf6Q9D4J7 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Phf6Q9D4J7 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Phf6Q9D4J7 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Phf6Q9D4J7 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Phf6Q9D4J7 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Phf6Q9D4J7 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Phf6Q9D4J7 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Phf6Q9D4J7 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Phf6Q9D4J7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Phf6Q9D4J7 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Phf6Q9D4J7 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Phf6Q9D4J7 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Phf6Q9D4J7 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Phf6Q9D4J7 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Phf6Q9D4J7 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Phf6Q9D4J7 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Phf6Q9D4J7 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Phf6Q9D4J7 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Phf6Q9D4J7 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Phf6Q9D4J7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Phf6Q9D4J7 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Phf6Q9D4J7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Phf6Q9D4J7 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Phf6Q9D4J7 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Phf6Q9D4J7 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Phf6Q9D4J7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Phf6Q9D4J7 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Phf6Q9D4J7 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Phf6Q9D4J7 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Phf6Q9D4J7 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Phf6Q9D4J7 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Phf6Q9D4J7 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Phf6Q9D4J7 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Phf6Q9D4J7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Phf6Q9D4J7 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms