Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3X3

4933428M09Rik, RIKEN cDNA 4933428M09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933428M09RikQ9D3X3 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
4933428M09RikQ9D3X3 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
4933428M09RikQ9D3X3 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
4933428M09RikQ9D3X3 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
4933428M09RikQ9D3X3 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
4933428M09RikQ9D3X3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
4933428M09RikQ9D3X3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
4933428M09RikQ9D3X3 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
4933428M09RikQ9D3X3 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
4933428M09RikQ9D3X3 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
4933428M09RikQ9D3X3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
4933428M09RikQ9D3X3 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
4933428M09RikQ9D3X3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
4933428M09RikQ9D3X3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
4933428M09RikQ9D3X3 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
4933428M09RikQ9D3X3 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
4933428M09RikQ9D3X3 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
4933428M09RikQ9D3X3 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
4933428M09RikQ9D3X3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
4933428M09RikQ9D3X3 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
4933428M09RikQ9D3X3 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
4933428M09RikQ9D3X3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
4933428M09RikQ9D3X3 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
4933428M09RikQ9D3X3 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
4933428M09RikQ9D3X3 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
4933428M09RikQ9D3X3 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
4933428M09RikQ9D3X3 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
4933428M09RikQ9D3X3 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
4933428M09RikQ9D3X3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
4933428M09RikQ9D3X3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
4933428M09RikQ9D3X3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
4933428M09RikQ9D3X3 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
4933428M09RikQ9D3X3 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
4933428M09RikQ9D3X3 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
4933428M09RikQ9D3X3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
4933428M09RikQ9D3X3 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
4933428M09RikQ9D3X3 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
4933428M09RikQ9D3X3 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
4933428M09RikQ9D3X3 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
4933428M09RikQ9D3X3 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
4933428M09RikQ9D3X3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
4933428M09RikQ9D3X3 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
4933428M09RikQ9D3X3 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
4933428M09RikQ9D3X3 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
4933428M09RikQ9D3X3 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
4933428M09RikQ9D3X3 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
4933428M09RikQ9D3X3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
4933428M09RikQ9D3X3 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
4933428M09RikQ9D3X3 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
4933428M09RikQ9D3X3 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
4933428M09RikQ9D3X3 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
4933428M09RikQ9D3X3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
4933428M09RikQ9D3X3 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
4933428M09RikQ9D3X3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
4933428M09RikQ9D3X3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
4933428M09RikQ9D3X3 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
4933428M09RikQ9D3X3 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
4933428M09RikQ9D3X3 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
4933428M09RikQ9D3X3 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
4933428M09RikQ9D3X3 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
4933428M09RikQ9D3X3 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
4933428M09RikQ9D3X3 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
4933428M09RikQ9D3X3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
4933428M09RikQ9D3X3 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
4933428M09RikQ9D3X3 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
4933428M09RikQ9D3X3 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
4933428M09RikQ9D3X3 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
4933428M09RikQ9D3X3 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
4933428M09RikQ9D3X3 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
4933428M09RikQ9D3X3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
4933428M09RikQ9D3X3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
4933428M09RikQ9D3X3 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
4933428M09RikQ9D3X3 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
4933428M09RikQ9D3X3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
4933428M09RikQ9D3X3 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
4933428M09RikQ9D3X3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
4933428M09RikQ9D3X3 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
4933428M09RikQ9D3X3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
4933428M09RikQ9D3X3 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
4933428M09RikQ9D3X3 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
4933428M09RikQ9D3X3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
4933428M09RikQ9D3X3 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
4933428M09RikQ9D3X3 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
4933428M09RikQ9D3X3 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
4933428M09RikQ9D3X3 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
4933428M09RikQ9D3X3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
4933428M09RikQ9D3X3 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
4933428M09RikQ9D3X3 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
4933428M09RikQ9D3X3 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
4933428M09RikQ9D3X3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
4933428M09RikQ9D3X3 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
4933428M09RikQ9D3X3 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
4933428M09RikQ9D3X3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
4933428M09RikQ9D3X3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
4933428M09RikQ9D3X3 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
4933428M09RikQ9D3X3 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
4933428M09RikQ9D3X3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
4933428M09RikQ9D3X3 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
4933428M09RikQ9D3X3 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
4933428M09RikQ9D3X3 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms