Protein–RNA interactions for Protein: Q9D309

Fam3b, Protein FAM3B, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam3bQ9D309 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fam3bQ9D309 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fam3bQ9D309 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fam3bQ9D309 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fam3bQ9D309 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fam3bQ9D309 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fam3bQ9D309 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fam3bQ9D309 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fam3bQ9D309 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fam3bQ9D309 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fam3bQ9D309 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fam3bQ9D309 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fam3bQ9D309 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fam3bQ9D309 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fam3bQ9D309 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fam3bQ9D309 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fam3bQ9D309 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fam3bQ9D309 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fam3bQ9D309 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Fam3bQ9D309 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fam3bQ9D309 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fam3bQ9D309 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fam3bQ9D309 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fam3bQ9D309 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fam3bQ9D309 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fam3bQ9D309 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Fam3bQ9D309 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam3bQ9D309 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam3bQ9D309 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam3bQ9D309 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam3bQ9D309 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam3bQ9D309 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam3bQ9D309 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam3bQ9D309 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam3bQ9D309 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam3bQ9D309 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fam3bQ9D309 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Fam3bQ9D309 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Fam3bQ9D309 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Fam3bQ9D309 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fam3bQ9D309 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fam3bQ9D309 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fam3bQ9D309 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fam3bQ9D309 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fam3bQ9D309 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fam3bQ9D309 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fam3bQ9D309 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fam3bQ9D309 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fam3bQ9D309 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fam3bQ9D309 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fam3bQ9D309 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fam3bQ9D309 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fam3bQ9D309 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fam3bQ9D309 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fam3bQ9D309 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fam3bQ9D309 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fam3bQ9D309 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Fam3bQ9D309 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fam3bQ9D309 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fam3bQ9D309 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fam3bQ9D309 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fam3bQ9D309 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fam3bQ9D309 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fam3bQ9D309 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Fam3bQ9D309 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fam3bQ9D309 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fam3bQ9D309 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fam3bQ9D309 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fam3bQ9D309 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fam3bQ9D309 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fam3bQ9D309 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fam3bQ9D309 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fam3bQ9D309 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fam3bQ9D309 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Fam3bQ9D309 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Fam3bQ9D309 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fam3bQ9D309 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fam3bQ9D309 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fam3bQ9D309 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fam3bQ9D309 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Fam3bQ9D309 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Fam3bQ9D309 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fam3bQ9D309 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fam3bQ9D309 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fam3bQ9D309 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Fam3bQ9D309 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Fam3bQ9D309 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fam3bQ9D309 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fam3bQ9D309 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fam3bQ9D309 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Fam3bQ9D309 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fam3bQ9D309 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fam3bQ9D309 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fam3bQ9D309 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fam3bQ9D309 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fam3bQ9D309 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fam3bQ9D309 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fam3bQ9D309 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fam3bQ9D309 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Fam3bQ9D309 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms