Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Q2

Trmt44, Probable tRNA (uracil-O(2)-)-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt44Q9D2Q2 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trmt44Q9D2Q2 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Trmt44Q9D2Q2 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trmt44Q9D2Q2 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trmt44Q9D2Q2 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trmt44Q9D2Q2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trmt44Q9D2Q2 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trmt44Q9D2Q2 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trmt44Q9D2Q2 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trmt44Q9D2Q2 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trmt44Q9D2Q2 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trmt44Q9D2Q2 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Trmt44Q9D2Q2 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trmt44Q9D2Q2 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Trmt44Q9D2Q2 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trmt44Q9D2Q2 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trmt44Q9D2Q2 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trmt44Q9D2Q2 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trmt44Q9D2Q2 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trmt44Q9D2Q2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trmt44Q9D2Q2 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trmt44Q9D2Q2 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trmt44Q9D2Q2 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trmt44Q9D2Q2 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trmt44Q9D2Q2 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trmt44Q9D2Q2 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trmt44Q9D2Q2 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Trmt44Q9D2Q2 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trmt44Q9D2Q2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trmt44Q9D2Q2 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trmt44Q9D2Q2 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trmt44Q9D2Q2 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trmt44Q9D2Q2 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trmt44Q9D2Q2 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trmt44Q9D2Q2 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trmt44Q9D2Q2 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trmt44Q9D2Q2 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trmt44Q9D2Q2 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trmt44Q9D2Q2 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trmt44Q9D2Q2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trmt44Q9D2Q2 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trmt44Q9D2Q2 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trmt44Q9D2Q2 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trmt44Q9D2Q2 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trmt44Q9D2Q2 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trmt44Q9D2Q2 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trmt44Q9D2Q2 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trmt44Q9D2Q2 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trmt44Q9D2Q2 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trmt44Q9D2Q2 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trmt44Q9D2Q2 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trmt44Q9D2Q2 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trmt44Q9D2Q2 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trmt44Q9D2Q2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trmt44Q9D2Q2 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trmt44Q9D2Q2 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trmt44Q9D2Q2 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trmt44Q9D2Q2 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trmt44Q9D2Q2 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trmt44Q9D2Q2 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trmt44Q9D2Q2 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trmt44Q9D2Q2 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trmt44Q9D2Q2 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trmt44Q9D2Q2 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Trmt44Q9D2Q2 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trmt44Q9D2Q2 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trmt44Q9D2Q2 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trmt44Q9D2Q2 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Trmt44Q9D2Q2 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trmt44Q9D2Q2 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trmt44Q9D2Q2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trmt44Q9D2Q2 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trmt44Q9D2Q2 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trmt44Q9D2Q2 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trmt44Q9D2Q2 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trmt44Q9D2Q2 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trmt44Q9D2Q2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trmt44Q9D2Q2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Trmt44Q9D2Q2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Trmt44Q9D2Q2 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trmt44Q9D2Q2 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trmt44Q9D2Q2 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trmt44Q9D2Q2 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trmt44Q9D2Q2 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trmt44Q9D2Q2 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trmt44Q9D2Q2 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trmt44Q9D2Q2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trmt44Q9D2Q2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trmt44Q9D2Q2 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trmt44Q9D2Q2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trmt44Q9D2Q2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trmt44Q9D2Q2 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trmt44Q9D2Q2 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trmt44Q9D2Q2 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trmt44Q9D2Q2 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trmt44Q9D2Q2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trmt44Q9D2Q2 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trmt44Q9D2Q2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trmt44Q9D2Q2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trmt44Q9D2Q2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms