Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trappc6bQ9D289 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trappc6bQ9D289 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trappc6bQ9D289 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Trappc6bQ9D289 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trappc6bQ9D289 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trappc6bQ9D289 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trappc6bQ9D289 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trappc6bQ9D289 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trappc6bQ9D289 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Trappc6bQ9D289 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trappc6bQ9D289 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trappc6bQ9D289 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trappc6bQ9D289 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trappc6bQ9D289 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trappc6bQ9D289 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trappc6bQ9D289 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trappc6bQ9D289 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trappc6bQ9D289 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trappc6bQ9D289 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trappc6bQ9D289 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trappc6bQ9D289 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Trappc6bQ9D289 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trappc6bQ9D289 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trappc6bQ9D289 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Trappc6bQ9D289 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Trappc6bQ9D289 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trappc6bQ9D289 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trappc6bQ9D289 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trappc6bQ9D289 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trappc6bQ9D289 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trappc6bQ9D289 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trappc6bQ9D289 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Trappc6bQ9D289 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trappc6bQ9D289 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trappc6bQ9D289 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trappc6bQ9D289 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trappc6bQ9D289 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trappc6bQ9D289 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trappc6bQ9D289 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trappc6bQ9D289 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trappc6bQ9D289 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trappc6bQ9D289 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trappc6bQ9D289 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trappc6bQ9D289 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trappc6bQ9D289 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trappc6bQ9D289 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trappc6bQ9D289 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trappc6bQ9D289 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trappc6bQ9D289 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trappc6bQ9D289 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trappc6bQ9D289 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trappc6bQ9D289 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trappc6bQ9D289 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trappc6bQ9D289 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trappc6bQ9D289 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trappc6bQ9D289 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trappc6bQ9D289 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trappc6bQ9D289 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trappc6bQ9D289 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trappc6bQ9D289 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trappc6bQ9D289 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Trappc6bQ9D289 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc6bQ9D289 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc6bQ9D289 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc6bQ9D289 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc6bQ9D289 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc6bQ9D289 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc6bQ9D289 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc6bQ9D289 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc6bQ9D289 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc6bQ9D289 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc6bQ9D289 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trappc6bQ9D289 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trappc6bQ9D289 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trappc6bQ9D289 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Trappc6bQ9D289 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trappc6bQ9D289 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trappc6bQ9D289 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trappc6bQ9D289 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trappc6bQ9D289 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trappc6bQ9D289 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trappc6bQ9D289 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trappc6bQ9D289 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trappc6bQ9D289 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trappc6bQ9D289 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Trappc6bQ9D289 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trappc6bQ9D289 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trappc6bQ9D289 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trappc6bQ9D289 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Trappc6bQ9D289 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trappc6bQ9D289 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trappc6bQ9D289 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trappc6bQ9D289 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trappc6bQ9D289 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Trappc6bQ9D289 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trappc6bQ9D289 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trappc6bQ9D289 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trappc6bQ9D289 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trappc6bQ9D289 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms