Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1T0

Lingo1, Leucine-rich repeat and immunoglobulin-like domain-containing nogo receptor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lingo1Q9D1T0 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lingo1Q9D1T0 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lingo1Q9D1T0 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lingo1Q9D1T0 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lingo1Q9D1T0 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lingo1Q9D1T0 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lingo1Q9D1T0 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lingo1Q9D1T0 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lingo1Q9D1T0 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lingo1Q9D1T0 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lingo1Q9D1T0 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lingo1Q9D1T0 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lingo1Q9D1T0 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lingo1Q9D1T0 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lingo1Q9D1T0 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Lingo1Q9D1T0 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lingo1Q9D1T0 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lingo1Q9D1T0 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lingo1Q9D1T0 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lingo1Q9D1T0 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lingo1Q9D1T0 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lingo1Q9D1T0 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lingo1Q9D1T0 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lingo1Q9D1T0 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Lingo1Q9D1T0 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Lingo1Q9D1T0 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Lingo1Q9D1T0 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Lingo1Q9D1T0 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Lingo1Q9D1T0 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Lingo1Q9D1T0 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Lingo1Q9D1T0 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Lingo1Q9D1T0 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Lingo1Q9D1T0 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Lingo1Q9D1T0 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lingo1Q9D1T0 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lingo1Q9D1T0 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lingo1Q9D1T0 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lingo1Q9D1T0 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lingo1Q9D1T0 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lingo1Q9D1T0 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lingo1Q9D1T0 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lingo1Q9D1T0 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lingo1Q9D1T0 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lingo1Q9D1T0 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lingo1Q9D1T0 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lingo1Q9D1T0 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lingo1Q9D1T0 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lingo1Q9D1T0 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lingo1Q9D1T0 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lingo1Q9D1T0 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Lingo1Q9D1T0 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lingo1Q9D1T0 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lingo1Q9D1T0 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lingo1Q9D1T0 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lingo1Q9D1T0 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lingo1Q9D1T0 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lingo1Q9D1T0 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lingo1Q9D1T0 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lingo1Q9D1T0 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lingo1Q9D1T0 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lingo1Q9D1T0 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Lingo1Q9D1T0 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Lingo1Q9D1T0 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lingo1Q9D1T0 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lingo1Q9D1T0 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lingo1Q9D1T0 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lingo1Q9D1T0 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lingo1Q9D1T0 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lingo1Q9D1T0 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Lingo1Q9D1T0 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lingo1Q9D1T0 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lingo1Q9D1T0 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lingo1Q9D1T0 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lingo1Q9D1T0 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lingo1Q9D1T0 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Lingo1Q9D1T0 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lingo1Q9D1T0 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lingo1Q9D1T0 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lingo1Q9D1T0 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lingo1Q9D1T0 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lingo1Q9D1T0 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Lingo1Q9D1T0 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Lingo1Q9D1T0 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lingo1Q9D1T0 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lingo1Q9D1T0 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lingo1Q9D1T0 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lingo1Q9D1T0 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lingo1Q9D1T0 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lingo1Q9D1T0 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lingo1Q9D1T0 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lingo1Q9D1T0 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Lingo1Q9D1T0 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lingo1Q9D1T0 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lingo1Q9D1T0 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lingo1Q9D1T0 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lingo1Q9D1T0 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lingo1Q9D1T0 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lingo1Q9D1T0 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lingo1Q9D1T0 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Lingo1Q9D1T0 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms