Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1M0

Sec13, Protein SEC13 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec13Q9D1M0 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sec13Q9D1M0 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Sec13Q9D1M0 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Sec13Q9D1M0 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sec13Q9D1M0 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sec13Q9D1M0 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sec13Q9D1M0 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sec13Q9D1M0 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sec13Q9D1M0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sec13Q9D1M0 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Sec13Q9D1M0 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sec13Q9D1M0 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sec13Q9D1M0 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sec13Q9D1M0 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sec13Q9D1M0 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sec13Q9D1M0 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sec13Q9D1M0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sec13Q9D1M0 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sec13Q9D1M0 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sec13Q9D1M0 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sec13Q9D1M0 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sec13Q9D1M0 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sec13Q9D1M0 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sec13Q9D1M0 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sec13Q9D1M0 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sec13Q9D1M0 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sec13Q9D1M0 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sec13Q9D1M0 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Sec13Q9D1M0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sec13Q9D1M0 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sec13Q9D1M0 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sec13Q9D1M0 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Sec13Q9D1M0 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sec13Q9D1M0 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sec13Q9D1M0 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sec13Q9D1M0 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sec13Q9D1M0 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sec13Q9D1M0 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sec13Q9D1M0 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sec13Q9D1M0 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sec13Q9D1M0 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sec13Q9D1M0 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sec13Q9D1M0 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sec13Q9D1M0 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sec13Q9D1M0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sec13Q9D1M0 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Sec13Q9D1M0 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sec13Q9D1M0 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sec13Q9D1M0 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sec13Q9D1M0 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sec13Q9D1M0 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sec13Q9D1M0 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sec13Q9D1M0 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sec13Q9D1M0 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sec13Q9D1M0 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sec13Q9D1M0 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sec13Q9D1M0 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sec13Q9D1M0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sec13Q9D1M0 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sec13Q9D1M0 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sec13Q9D1M0 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sec13Q9D1M0 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sec13Q9D1M0 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Sec13Q9D1M0 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sec13Q9D1M0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sec13Q9D1M0 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sec13Q9D1M0 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sec13Q9D1M0 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sec13Q9D1M0 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sec13Q9D1M0 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sec13Q9D1M0 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sec13Q9D1M0 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sec13Q9D1M0 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sec13Q9D1M0 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sec13Q9D1M0 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sec13Q9D1M0 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sec13Q9D1M0 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sec13Q9D1M0 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sec13Q9D1M0 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sec13Q9D1M0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sec13Q9D1M0 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sec13Q9D1M0 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sec13Q9D1M0 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sec13Q9D1M0 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sec13Q9D1M0 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Sec13Q9D1M0 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sec13Q9D1M0 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sec13Q9D1M0 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sec13Q9D1M0 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sec13Q9D1M0 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sec13Q9D1M0 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sec13Q9D1M0 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sec13Q9D1M0 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sec13Q9D1M0 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sec13Q9D1M0 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sec13Q9D1M0 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sec13Q9D1M0 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sec13Q9D1M0 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sec13Q9D1M0 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sec13Q9D1M0 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms