Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E5

Lmbr1l, Protein LMBR1L, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1lQ9D1E5 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Lmbr1lQ9D1E5 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Lmbr1lQ9D1E5 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Lmbr1lQ9D1E5 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Lmbr1lQ9D1E5 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Lmbr1lQ9D1E5 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Lmbr1lQ9D1E5 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Lmbr1lQ9D1E5 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Lmbr1lQ9D1E5 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Lmbr1lQ9D1E5 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Lmbr1lQ9D1E5 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Lmbr1lQ9D1E5 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Lmbr1lQ9D1E5 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Lmbr1lQ9D1E5 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Lmbr1lQ9D1E5 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Lmbr1lQ9D1E5 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Lmbr1lQ9D1E5 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Lmbr1lQ9D1E5 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Lmbr1lQ9D1E5 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Lmbr1lQ9D1E5 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Lmbr1lQ9D1E5 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Lmbr1lQ9D1E5 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Lmbr1lQ9D1E5 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Lmbr1lQ9D1E5 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.8
Lmbr1lQ9D1E5 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Lmbr1lQ9D1E5 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Lmbr1lQ9D1E5 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Lmbr1lQ9D1E5 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Lmbr1lQ9D1E5 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Lmbr1lQ9D1E5 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Lmbr1lQ9D1E5 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Lmbr1lQ9D1E5 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Lmbr1lQ9D1E5 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Lmbr1lQ9D1E5 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Lmbr1lQ9D1E5 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Lmbr1lQ9D1E5 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Lmbr1lQ9D1E5 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Lmbr1lQ9D1E5 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Lmbr1lQ9D1E5 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Lmbr1lQ9D1E5 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Lmbr1lQ9D1E5 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Lmbr1lQ9D1E5 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Lmbr1lQ9D1E5 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Lmbr1lQ9D1E5 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Lmbr1lQ9D1E5 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Lmbr1lQ9D1E5 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Lmbr1lQ9D1E5 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Lmbr1lQ9D1E5 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Lmbr1lQ9D1E5 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Lmbr1lQ9D1E5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Lmbr1lQ9D1E5 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Lmbr1lQ9D1E5 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Lmbr1lQ9D1E5 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Lmbr1lQ9D1E5 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Lmbr1lQ9D1E5 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Lmbr1lQ9D1E5 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Lmbr1lQ9D1E5 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Lmbr1lQ9D1E5 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Lmbr1lQ9D1E5 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Lmbr1lQ9D1E5 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Lmbr1lQ9D1E5 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Lmbr1lQ9D1E5 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Lmbr1lQ9D1E5 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Lmbr1lQ9D1E5 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Lmbr1lQ9D1E5 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Lmbr1lQ9D1E5 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Lmbr1lQ9D1E5 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Lmbr1lQ9D1E5 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Lmbr1lQ9D1E5 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Lmbr1lQ9D1E5 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Lmbr1lQ9D1E5 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Lmbr1lQ9D1E5 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Lmbr1lQ9D1E5 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Lmbr1lQ9D1E5 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Lmbr1lQ9D1E5 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Lmbr1lQ9D1E5 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Lmbr1lQ9D1E5 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Lmbr1lQ9D1E5 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Lmbr1lQ9D1E5 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Lmbr1lQ9D1E5 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Lmbr1lQ9D1E5 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Lmbr1lQ9D1E5 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Lmbr1lQ9D1E5 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Lmbr1lQ9D1E5 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Lmbr1lQ9D1E5 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Lmbr1lQ9D1E5 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Lmbr1lQ9D1E5 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Lmbr1lQ9D1E5 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Lmbr1lQ9D1E5 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Lmbr1lQ9D1E5 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Lmbr1lQ9D1E5 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Lmbr1lQ9D1E5 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Lmbr1lQ9D1E5 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Lmbr1lQ9D1E5 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Lmbr1lQ9D1E5 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Lmbr1lQ9D1E5 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Lmbr1lQ9D1E5 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Lmbr1lQ9D1E5 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Lmbr1lQ9D1E5 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Lmbr1lQ9D1E5 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms