Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZX0

Elp3, Elongator complex protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elp3Q9CZX0 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Elp3Q9CZX0 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Elp3Q9CZX0 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Elp3Q9CZX0 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Elp3Q9CZX0 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Elp3Q9CZX0 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Elp3Q9CZX0 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Elp3Q9CZX0 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Elp3Q9CZX0 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Elp3Q9CZX0 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Elp3Q9CZX0 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Elp3Q9CZX0 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Elp3Q9CZX0 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Elp3Q9CZX0 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Elp3Q9CZX0 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Elp3Q9CZX0 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Elp3Q9CZX0 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Elp3Q9CZX0 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Elp3Q9CZX0 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Elp3Q9CZX0 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Elp3Q9CZX0 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Elp3Q9CZX0 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Elp3Q9CZX0 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Elp3Q9CZX0 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Elp3Q9CZX0 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Elp3Q9CZX0 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Elp3Q9CZX0 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Elp3Q9CZX0 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Elp3Q9CZX0 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Elp3Q9CZX0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Elp3Q9CZX0 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Elp3Q9CZX0 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Elp3Q9CZX0 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Elp3Q9CZX0 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Elp3Q9CZX0 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Elp3Q9CZX0 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Elp3Q9CZX0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Elp3Q9CZX0 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Elp3Q9CZX0 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Elp3Q9CZX0 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Elp3Q9CZX0 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Elp3Q9CZX0 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Elp3Q9CZX0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Elp3Q9CZX0 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Elp3Q9CZX0 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Elp3Q9CZX0 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Elp3Q9CZX0 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Elp3Q9CZX0 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Elp3Q9CZX0 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Elp3Q9CZX0 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Elp3Q9CZX0 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Elp3Q9CZX0 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Elp3Q9CZX0 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Elp3Q9CZX0 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Elp3Q9CZX0 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Elp3Q9CZX0 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Elp3Q9CZX0 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Elp3Q9CZX0 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Elp3Q9CZX0 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Elp3Q9CZX0 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Elp3Q9CZX0 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Elp3Q9CZX0 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Elp3Q9CZX0 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Elp3Q9CZX0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Elp3Q9CZX0 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Elp3Q9CZX0 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Elp3Q9CZX0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Elp3Q9CZX0 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Elp3Q9CZX0 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Elp3Q9CZX0 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Elp3Q9CZX0 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Elp3Q9CZX0 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Elp3Q9CZX0 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Elp3Q9CZX0 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Elp3Q9CZX0 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Elp3Q9CZX0 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Elp3Q9CZX0 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Elp3Q9CZX0 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Elp3Q9CZX0 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Elp3Q9CZX0 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Elp3Q9CZX0 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Elp3Q9CZX0 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Elp3Q9CZX0 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Elp3Q9CZX0 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Elp3Q9CZX0 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Elp3Q9CZX0 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Elp3Q9CZX0 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Elp3Q9CZX0 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Elp3Q9CZX0 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Elp3Q9CZX0 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Elp3Q9CZX0 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Elp3Q9CZX0 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Elp3Q9CZX0 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Elp3Q9CZX0 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Elp3Q9CZX0 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Elp3Q9CZX0 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Elp3Q9CZX0 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Elp3Q9CZX0 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Elp3Q9CZX0 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Elp3Q9CZX0 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 304 ms