Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN7

Shmt2, Serine hydroxymethyltransferase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shmt2Q9CZN7 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Shmt2Q9CZN7 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Shmt2Q9CZN7 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Shmt2Q9CZN7 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Shmt2Q9CZN7 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Shmt2Q9CZN7 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Shmt2Q9CZN7 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Shmt2Q9CZN7 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Shmt2Q9CZN7 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Shmt2Q9CZN7 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Shmt2Q9CZN7 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Shmt2Q9CZN7 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Shmt2Q9CZN7 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Shmt2Q9CZN7 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Shmt2Q9CZN7 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Shmt2Q9CZN7 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Shmt2Q9CZN7 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Shmt2Q9CZN7 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Shmt2Q9CZN7 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Shmt2Q9CZN7 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Shmt2Q9CZN7 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Shmt2Q9CZN7 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Shmt2Q9CZN7 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Shmt2Q9CZN7 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Shmt2Q9CZN7 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Shmt2Q9CZN7 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Shmt2Q9CZN7 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Shmt2Q9CZN7 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Shmt2Q9CZN7 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Shmt2Q9CZN7 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Shmt2Q9CZN7 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Shmt2Q9CZN7 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Shmt2Q9CZN7 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Shmt2Q9CZN7 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Shmt2Q9CZN7 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Shmt2Q9CZN7 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Shmt2Q9CZN7 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Shmt2Q9CZN7 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Shmt2Q9CZN7 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Shmt2Q9CZN7 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Shmt2Q9CZN7 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Shmt2Q9CZN7 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Shmt2Q9CZN7 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Shmt2Q9CZN7 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Shmt2Q9CZN7 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Shmt2Q9CZN7 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Shmt2Q9CZN7 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Shmt2Q9CZN7 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Shmt2Q9CZN7 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Shmt2Q9CZN7 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Shmt2Q9CZN7 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Shmt2Q9CZN7 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Shmt2Q9CZN7 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Shmt2Q9CZN7 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Shmt2Q9CZN7 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Shmt2Q9CZN7 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Shmt2Q9CZN7 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Shmt2Q9CZN7 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Shmt2Q9CZN7 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Shmt2Q9CZN7 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Shmt2Q9CZN7 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Shmt2Q9CZN7 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Shmt2Q9CZN7 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Shmt2Q9CZN7 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Shmt2Q9CZN7 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Shmt2Q9CZN7 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Shmt2Q9CZN7 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Shmt2Q9CZN7 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Shmt2Q9CZN7 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Shmt2Q9CZN7 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Shmt2Q9CZN7 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Shmt2Q9CZN7 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Shmt2Q9CZN7 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Shmt2Q9CZN7 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Shmt2Q9CZN7 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Shmt2Q9CZN7 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Shmt2Q9CZN7 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Shmt2Q9CZN7 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Shmt2Q9CZN7 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Shmt2Q9CZN7 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Shmt2Q9CZN7 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Shmt2Q9CZN7 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Shmt2Q9CZN7 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Shmt2Q9CZN7 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Shmt2Q9CZN7 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Shmt2Q9CZN7 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Shmt2Q9CZN7 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Shmt2Q9CZN7 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Shmt2Q9CZN7 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Shmt2Q9CZN7 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Shmt2Q9CZN7 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Shmt2Q9CZN7 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Shmt2Q9CZN7 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Shmt2Q9CZN7 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Shmt2Q9CZN7 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Shmt2Q9CZN7 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Shmt2Q9CZN7 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Shmt2Q9CZN7 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Shmt2Q9CZN7 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Shmt2Q9CZN7 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms