Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZB3

Thumpd2, THUMP domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thumpd2Q9CZB3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Thumpd2Q9CZB3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Thumpd2Q9CZB3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Thumpd2Q9CZB3 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Thumpd2Q9CZB3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Thumpd2Q9CZB3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Thumpd2Q9CZB3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Thumpd2Q9CZB3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Thumpd2Q9CZB3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Thumpd2Q9CZB3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Thumpd2Q9CZB3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Thumpd2Q9CZB3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Thumpd2Q9CZB3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Thumpd2Q9CZB3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Thumpd2Q9CZB3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Thumpd2Q9CZB3 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Thumpd2Q9CZB3 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Thumpd2Q9CZB3 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Thumpd2Q9CZB3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Thumpd2Q9CZB3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Thumpd2Q9CZB3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Thumpd2Q9CZB3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Thumpd2Q9CZB3 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Thumpd2Q9CZB3 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Thumpd2Q9CZB3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Thumpd2Q9CZB3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Thumpd2Q9CZB3 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Thumpd2Q9CZB3 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Thumpd2Q9CZB3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Thumpd2Q9CZB3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Thumpd2Q9CZB3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Thumpd2Q9CZB3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Thumpd2Q9CZB3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Thumpd2Q9CZB3 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Thumpd2Q9CZB3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Thumpd2Q9CZB3 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Thumpd2Q9CZB3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Thumpd2Q9CZB3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Thumpd2Q9CZB3 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Thumpd2Q9CZB3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Thumpd2Q9CZB3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Thumpd2Q9CZB3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Thumpd2Q9CZB3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Thumpd2Q9CZB3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Thumpd2Q9CZB3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Thumpd2Q9CZB3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Thumpd2Q9CZB3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Thumpd2Q9CZB3 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Thumpd2Q9CZB3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Thumpd2Q9CZB3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Thumpd2Q9CZB3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Thumpd2Q9CZB3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Thumpd2Q9CZB3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Thumpd2Q9CZB3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Thumpd2Q9CZB3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Thumpd2Q9CZB3 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Thumpd2Q9CZB3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Thumpd2Q9CZB3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Thumpd2Q9CZB3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Thumpd2Q9CZB3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Thumpd2Q9CZB3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Thumpd2Q9CZB3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Thumpd2Q9CZB3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Thumpd2Q9CZB3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Thumpd2Q9CZB3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Thumpd2Q9CZB3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Thumpd2Q9CZB3 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Thumpd2Q9CZB3 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Thumpd2Q9CZB3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Thumpd2Q9CZB3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Thumpd2Q9CZB3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Thumpd2Q9CZB3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Thumpd2Q9CZB3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Thumpd2Q9CZB3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Thumpd2Q9CZB3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Thumpd2Q9CZB3 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Thumpd2Q9CZB3 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Thumpd2Q9CZB3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Thumpd2Q9CZB3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Thumpd2Q9CZB3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Thumpd2Q9CZB3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Thumpd2Q9CZB3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Thumpd2Q9CZB3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Thumpd2Q9CZB3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Thumpd2Q9CZB3 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Thumpd2Q9CZB3 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Thumpd2Q9CZB3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Thumpd2Q9CZB3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Thumpd2Q9CZB3 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Thumpd2Q9CZB3 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Thumpd2Q9CZB3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Thumpd2Q9CZB3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Thumpd2Q9CZB3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Thumpd2Q9CZB3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Thumpd2Q9CZB3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Thumpd2Q9CZB3 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Thumpd2Q9CZB3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Thumpd2Q9CZB3 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Thumpd2Q9CZB3 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Thumpd2Q9CZB3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 117.4 ms