Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ69

Cmtm6, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm6Q9CZ69 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cmtm6Q9CZ69 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cmtm6Q9CZ69 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cmtm6Q9CZ69 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cmtm6Q9CZ69 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cmtm6Q9CZ69 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cmtm6Q9CZ69 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cmtm6Q9CZ69 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cmtm6Q9CZ69 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cmtm6Q9CZ69 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cmtm6Q9CZ69 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cmtm6Q9CZ69 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cmtm6Q9CZ69 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cmtm6Q9CZ69 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cmtm6Q9CZ69 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cmtm6Q9CZ69 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cmtm6Q9CZ69 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cmtm6Q9CZ69 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cmtm6Q9CZ69 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cmtm6Q9CZ69 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cmtm6Q9CZ69 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cmtm6Q9CZ69 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cmtm6Q9CZ69 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cmtm6Q9CZ69 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cmtm6Q9CZ69 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cmtm6Q9CZ69 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cmtm6Q9CZ69 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cmtm6Q9CZ69 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cmtm6Q9CZ69 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cmtm6Q9CZ69 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cmtm6Q9CZ69 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Cmtm6Q9CZ69 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cmtm6Q9CZ69 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cmtm6Q9CZ69 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cmtm6Q9CZ69 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cmtm6Q9CZ69 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cmtm6Q9CZ69 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cmtm6Q9CZ69 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cmtm6Q9CZ69 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cmtm6Q9CZ69 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cmtm6Q9CZ69 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cmtm6Q9CZ69 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cmtm6Q9CZ69 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cmtm6Q9CZ69 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cmtm6Q9CZ69 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cmtm6Q9CZ69 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cmtm6Q9CZ69 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cmtm6Q9CZ69 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cmtm6Q9CZ69 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cmtm6Q9CZ69 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cmtm6Q9CZ69 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cmtm6Q9CZ69 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cmtm6Q9CZ69 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cmtm6Q9CZ69 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cmtm6Q9CZ69 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cmtm6Q9CZ69 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cmtm6Q9CZ69 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cmtm6Q9CZ69 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cmtm6Q9CZ69 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cmtm6Q9CZ69 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cmtm6Q9CZ69 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cmtm6Q9CZ69 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cmtm6Q9CZ69 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cmtm6Q9CZ69 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cmtm6Q9CZ69 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cmtm6Q9CZ69 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cmtm6Q9CZ69 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cmtm6Q9CZ69 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cmtm6Q9CZ69 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cmtm6Q9CZ69 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cmtm6Q9CZ69 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Cmtm6Q9CZ69 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cmtm6Q9CZ69 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cmtm6Q9CZ69 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cmtm6Q9CZ69 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cmtm6Q9CZ69 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cmtm6Q9CZ69 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cmtm6Q9CZ69 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cmtm6Q9CZ69 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cmtm6Q9CZ69 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cmtm6Q9CZ69 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cmtm6Q9CZ69 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cmtm6Q9CZ69 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cmtm6Q9CZ69 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cmtm6Q9CZ69 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cmtm6Q9CZ69 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cmtm6Q9CZ69 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cmtm6Q9CZ69 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cmtm6Q9CZ69 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cmtm6Q9CZ69 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cmtm6Q9CZ69 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cmtm6Q9CZ69 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cmtm6Q9CZ69 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cmtm6Q9CZ69 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cmtm6Q9CZ69 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cmtm6Q9CZ69 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Cmtm6Q9CZ69 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cmtm6Q9CZ69 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cmtm6Q9CZ69 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cmtm6Q9CZ69 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms