Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ28

Snf8, Vacuolar-sorting protein SNF8, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snf8Q9CZ28 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Snf8Q9CZ28 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Snf8Q9CZ28 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Snf8Q9CZ28 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Snf8Q9CZ28 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Snf8Q9CZ28 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Snf8Q9CZ28 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Snf8Q9CZ28 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Snf8Q9CZ28 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Snf8Q9CZ28 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Snf8Q9CZ28 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Snf8Q9CZ28 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Snf8Q9CZ28 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Snf8Q9CZ28 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Snf8Q9CZ28 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Snf8Q9CZ28 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Snf8Q9CZ28 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Snf8Q9CZ28 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Snf8Q9CZ28 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Snf8Q9CZ28 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Snf8Q9CZ28 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Snf8Q9CZ28 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Snf8Q9CZ28 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Snf8Q9CZ28 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Snf8Q9CZ28 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Snf8Q9CZ28 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Snf8Q9CZ28 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Snf8Q9CZ28 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Snf8Q9CZ28 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Snf8Q9CZ28 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Snf8Q9CZ28 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Snf8Q9CZ28 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Snf8Q9CZ28 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Snf8Q9CZ28 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Snf8Q9CZ28 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Snf8Q9CZ28 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Snf8Q9CZ28 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Snf8Q9CZ28 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Snf8Q9CZ28 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Snf8Q9CZ28 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Snf8Q9CZ28 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Snf8Q9CZ28 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Snf8Q9CZ28 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Snf8Q9CZ28 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Snf8Q9CZ28 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Snf8Q9CZ28 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Snf8Q9CZ28 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Snf8Q9CZ28 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Snf8Q9CZ28 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Snf8Q9CZ28 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Snf8Q9CZ28 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Snf8Q9CZ28 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Snf8Q9CZ28 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Snf8Q9CZ28 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Snf8Q9CZ28 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Snf8Q9CZ28 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Snf8Q9CZ28 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Snf8Q9CZ28 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Snf8Q9CZ28 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Snf8Q9CZ28 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Snf8Q9CZ28 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Snf8Q9CZ28 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Snf8Q9CZ28 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Snf8Q9CZ28 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Snf8Q9CZ28 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Snf8Q9CZ28 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Snf8Q9CZ28 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Snf8Q9CZ28 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Snf8Q9CZ28 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Snf8Q9CZ28 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Snf8Q9CZ28 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Snf8Q9CZ28 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Snf8Q9CZ28 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Snf8Q9CZ28 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Snf8Q9CZ28 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Snf8Q9CZ28 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Snf8Q9CZ28 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Snf8Q9CZ28 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Snf8Q9CZ28 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Snf8Q9CZ28 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Snf8Q9CZ28 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Snf8Q9CZ28 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Snf8Q9CZ28 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Snf8Q9CZ28 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Snf8Q9CZ28 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Snf8Q9CZ28 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Snf8Q9CZ28 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Snf8Q9CZ28 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Snf8Q9CZ28 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Snf8Q9CZ28 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Snf8Q9CZ28 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Snf8Q9CZ28 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Snf8Q9CZ28 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Snf8Q9CZ28 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Snf8Q9CZ28 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Snf8Q9CZ28 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Snf8Q9CZ28 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Snf8Q9CZ28 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Snf8Q9CZ28 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Snf8Q9CZ28 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms