Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWN7

Cnot11, CCR4-NOT transcription complex subunit 11, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot11Q9CWN7 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cnot11Q9CWN7 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cnot11Q9CWN7 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cnot11Q9CWN7 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cnot11Q9CWN7 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cnot11Q9CWN7 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cnot11Q9CWN7 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Cnot11Q9CWN7 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cnot11Q9CWN7 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cnot11Q9CWN7 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Cnot11Q9CWN7 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Cnot11Q9CWN7 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cnot11Q9CWN7 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cnot11Q9CWN7 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cnot11Q9CWN7 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cnot11Q9CWN7 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cnot11Q9CWN7 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cnot11Q9CWN7 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cnot11Q9CWN7 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cnot11Q9CWN7 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cnot11Q9CWN7 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cnot11Q9CWN7 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Cnot11Q9CWN7 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cnot11Q9CWN7 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cnot11Q9CWN7 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cnot11Q9CWN7 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cnot11Q9CWN7 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cnot11Q9CWN7 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cnot11Q9CWN7 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cnot11Q9CWN7 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cnot11Q9CWN7 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cnot11Q9CWN7 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cnot11Q9CWN7 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cnot11Q9CWN7 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cnot11Q9CWN7 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cnot11Q9CWN7 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cnot11Q9CWN7 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cnot11Q9CWN7 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cnot11Q9CWN7 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cnot11Q9CWN7 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cnot11Q9CWN7 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cnot11Q9CWN7 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cnot11Q9CWN7 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cnot11Q9CWN7 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cnot11Q9CWN7 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cnot11Q9CWN7 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cnot11Q9CWN7 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cnot11Q9CWN7 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cnot11Q9CWN7 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cnot11Q9CWN7 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cnot11Q9CWN7 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cnot11Q9CWN7 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cnot11Q9CWN7 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cnot11Q9CWN7 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cnot11Q9CWN7 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cnot11Q9CWN7 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cnot11Q9CWN7 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cnot11Q9CWN7 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Cnot11Q9CWN7 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cnot11Q9CWN7 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cnot11Q9CWN7 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cnot11Q9CWN7 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cnot11Q9CWN7 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cnot11Q9CWN7 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cnot11Q9CWN7 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cnot11Q9CWN7 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cnot11Q9CWN7 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cnot11Q9CWN7 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cnot11Q9CWN7 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cnot11Q9CWN7 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cnot11Q9CWN7 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cnot11Q9CWN7 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cnot11Q9CWN7 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cnot11Q9CWN7 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cnot11Q9CWN7 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cnot11Q9CWN7 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cnot11Q9CWN7 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cnot11Q9CWN7 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cnot11Q9CWN7 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cnot11Q9CWN7 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cnot11Q9CWN7 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cnot11Q9CWN7 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cnot11Q9CWN7 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cnot11Q9CWN7 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cnot11Q9CWN7 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cnot11Q9CWN7 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cnot11Q9CWN7 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cnot11Q9CWN7 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cnot11Q9CWN7 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cnot11Q9CWN7 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cnot11Q9CWN7 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cnot11Q9CWN7 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cnot11Q9CWN7 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cnot11Q9CWN7 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cnot11Q9CWN7 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cnot11Q9CWN7 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cnot11Q9CWN7 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cnot11Q9CWN7 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cnot11Q9CWN7 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cnot11Q9CWN7 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms