Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUU3

Sycp2, Synaptonemal complex protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp2Q9CUU3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
Sycp2Q9CUU3 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC40.14■■■■■ 4.02
Sycp2Q9CUU3 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
Sycp2Q9CUU3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
Sycp2Q9CUU3 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
Sycp2Q9CUU3 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC40.12■■■■■ 4.01
Sycp2Q9CUU3 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.11■■■■■ 4.01
Sycp2Q9CUU3 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
Sycp2Q9CUU3 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
Sycp2Q9CUU3 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC40.11■■■■■ 4.01
Sycp2Q9CUU3 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
Sycp2Q9CUU3 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
Sycp2Q9CUU3 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
Sycp2Q9CUU3 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC40.1■■■■■ 4.01
Sycp2Q9CUU3 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
Sycp2Q9CUU3 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.09■■■■■ 4.01
Sycp2Q9CUU3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
Sycp2Q9CUU3 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
Sycp2Q9CUU3 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
Sycp2Q9CUU3 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC40.08■■■■■ 4.01
Sycp2Q9CUU3 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
Sycp2Q9CUU3 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
Sycp2Q9CUU3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4.01
Sycp2Q9CUU3 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC40.07■■■■■ 4.01
Sycp2Q9CUU3 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC40.07■■■■■ 4.01
Sycp2Q9CUU3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4
Sycp2Q9CUU3 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC40.06■■■■■ 4
Sycp2Q9CUU3 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC40.06■■■■■ 4
Sycp2Q9CUU3 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
Sycp2Q9CUU3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC40.05■■■■■ 4
Sycp2Q9CUU3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC40.05■■■■■ 4
Sycp2Q9CUU3 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC40.05■■■■■ 4
Sycp2Q9CUU3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.04■■■■■ 4
Sycp2Q9CUU3 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC40.04■■■■■ 4
Sycp2Q9CUU3 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC40.04■■■■■ 4
Sycp2Q9CUU3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
Sycp2Q9CUU3 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
Sycp2Q9CUU3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
Sycp2Q9CUU3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
Sycp2Q9CUU3 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC40.02■■■■■ 4
Sycp2Q9CUU3 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC40.02■■■■■ 4
Sycp2Q9CUU3 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC40.02■■■■■ 4
Sycp2Q9CUU3 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
Sycp2Q9CUU3 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
Sycp2Q9CUU3 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC40.01■■■■■ 4
Sycp2Q9CUU3 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
Sycp2Q9CUU3 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.01■■■■■ 4
Sycp2Q9CUU3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
Sycp2Q9CUU3 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC40.01■■■■□ 3.99
Sycp2Q9CUU3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
Sycp2Q9CUU3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
Sycp2Q9CUU3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
Sycp2Q9CUU3 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
Sycp2Q9CUU3 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC40■■■■□ 3.99
Sycp2Q9CUU3 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
Sycp2Q9CUU3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
Sycp2Q9CUU3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
Sycp2Q9CUU3 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC39.99■■■■□ 3.99
Sycp2Q9CUU3 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC39.98■■■■□ 3.99
Sycp2Q9CUU3 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC39.98■■■■□ 3.99
Sycp2Q9CUU3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
Sycp2Q9CUU3 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC39.98■■■■□ 3.99
Sycp2Q9CUU3 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC39.97■■■■□ 3.99
Sycp2Q9CUU3 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
Sycp2Q9CUU3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
Sycp2Q9CUU3 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
Sycp2Q9CUU3 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
Sycp2Q9CUU3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
Sycp2Q9CUU3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
Sycp2Q9CUU3 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC39.96■■■■□ 3.99
Sycp2Q9CUU3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC39.96■■■■□ 3.99
Sycp2Q9CUU3 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
Sycp2Q9CUU3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
Sycp2Q9CUU3 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.95■■■■□ 3.99
Sycp2Q9CUU3 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
Sycp2Q9CUU3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC39.94■■■■□ 3.98
Sycp2Q9CUU3 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC39.94■■■■□ 3.98
Sycp2Q9CUU3 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
Sycp2Q9CUU3 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.93■■■■□ 3.98
Sycp2Q9CUU3 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
Sycp2Q9CUU3 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
Sycp2Q9CUU3 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
Sycp2Q9CUU3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC39.93■■■■□ 3.98
Sycp2Q9CUU3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
Sycp2Q9CUU3 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC39.92■■■■□ 3.98
Sycp2Q9CUU3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC39.92■■■■□ 3.98
Sycp2Q9CUU3 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.91■■■■□ 3.98
Sycp2Q9CUU3 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
Sycp2Q9CUU3 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
Sycp2Q9CUU3 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC39.9■■■■□ 3.98
Sycp2Q9CUU3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.89■■■■□ 3.98
Sycp2Q9CUU3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.98
Sycp2Q9CUU3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.98
Sycp2Q9CUU3 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC39.88■■■■□ 3.97
Sycp2Q9CUU3 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC39.87■■■■□ 3.97
Sycp2Q9CUU3 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC39.87■■■■□ 3.97
Sycp2Q9CUU3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC39.87■■■■□ 3.97
Sycp2Q9CUU3 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC39.87■■■■□ 3.97
Sycp2Q9CUU3 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC39.87■■■■□ 3.97
Sycp2Q9CUU3 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC39.86■■■■□ 3.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms