Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUJ5

4930524J08Rik, RIKEN cDNA 4930524J08 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930524J08RikQ9CUJ5 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
4930524J08RikQ9CUJ5 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
4930524J08RikQ9CUJ5 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
4930524J08RikQ9CUJ5 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
4930524J08RikQ9CUJ5 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
4930524J08RikQ9CUJ5 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
4930524J08RikQ9CUJ5 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
4930524J08RikQ9CUJ5 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
4930524J08RikQ9CUJ5 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
4930524J08RikQ9CUJ5 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
4930524J08RikQ9CUJ5 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
4930524J08RikQ9CUJ5 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
4930524J08RikQ9CUJ5 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
4930524J08RikQ9CUJ5 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
4930524J08RikQ9CUJ5 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
4930524J08RikQ9CUJ5 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
4930524J08RikQ9CUJ5 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
4930524J08RikQ9CUJ5 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
4930524J08RikQ9CUJ5 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
4930524J08RikQ9CUJ5 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
4930524J08RikQ9CUJ5 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
4930524J08RikQ9CUJ5 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
4930524J08RikQ9CUJ5 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
4930524J08RikQ9CUJ5 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
4930524J08RikQ9CUJ5 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
4930524J08RikQ9CUJ5 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
4930524J08RikQ9CUJ5 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
4930524J08RikQ9CUJ5 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
4930524J08RikQ9CUJ5 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
4930524J08RikQ9CUJ5 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
4930524J08RikQ9CUJ5 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
4930524J08RikQ9CUJ5 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
4930524J08RikQ9CUJ5 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
4930524J08RikQ9CUJ5 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
4930524J08RikQ9CUJ5 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
4930524J08RikQ9CUJ5 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
4930524J08RikQ9CUJ5 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
4930524J08RikQ9CUJ5 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
4930524J08RikQ9CUJ5 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
4930524J08RikQ9CUJ5 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
4930524J08RikQ9CUJ5 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
4930524J08RikQ9CUJ5 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
4930524J08RikQ9CUJ5 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
4930524J08RikQ9CUJ5 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
4930524J08RikQ9CUJ5 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
4930524J08RikQ9CUJ5 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
4930524J08RikQ9CUJ5 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
4930524J08RikQ9CUJ5 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
4930524J08RikQ9CUJ5 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
4930524J08RikQ9CUJ5 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
4930524J08RikQ9CUJ5 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
4930524J08RikQ9CUJ5 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
4930524J08RikQ9CUJ5 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
4930524J08RikQ9CUJ5 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
4930524J08RikQ9CUJ5 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
4930524J08RikQ9CUJ5 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
4930524J08RikQ9CUJ5 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
4930524J08RikQ9CUJ5 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
4930524J08RikQ9CUJ5 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
4930524J08RikQ9CUJ5 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
4930524J08RikQ9CUJ5 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
4930524J08RikQ9CUJ5 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
4930524J08RikQ9CUJ5 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
4930524J08RikQ9CUJ5 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
4930524J08RikQ9CUJ5 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
4930524J08RikQ9CUJ5 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
4930524J08RikQ9CUJ5 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
4930524J08RikQ9CUJ5 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
4930524J08RikQ9CUJ5 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
4930524J08RikQ9CUJ5 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
4930524J08RikQ9CUJ5 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
4930524J08RikQ9CUJ5 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
4930524J08RikQ9CUJ5 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
4930524J08RikQ9CUJ5 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
4930524J08RikQ9CUJ5 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
4930524J08RikQ9CUJ5 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
4930524J08RikQ9CUJ5 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
4930524J08RikQ9CUJ5 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
4930524J08RikQ9CUJ5 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
4930524J08RikQ9CUJ5 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
4930524J08RikQ9CUJ5 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
4930524J08RikQ9CUJ5 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
4930524J08RikQ9CUJ5 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
4930524J08RikQ9CUJ5 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
4930524J08RikQ9CUJ5 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
4930524J08RikQ9CUJ5 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
4930524J08RikQ9CUJ5 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
4930524J08RikQ9CUJ5 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
4930524J08RikQ9CUJ5 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
4930524J08RikQ9CUJ5 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
4930524J08RikQ9CUJ5 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
4930524J08RikQ9CUJ5 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
4930524J08RikQ9CUJ5 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
4930524J08RikQ9CUJ5 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms