Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTH6

Fcf1, rRNA-processing protein FCF1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcf1Q9CTH6 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Fcf1Q9CTH6 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fcf1Q9CTH6 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fcf1Q9CTH6 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fcf1Q9CTH6 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fcf1Q9CTH6 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fcf1Q9CTH6 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Fcf1Q9CTH6 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Fcf1Q9CTH6 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fcf1Q9CTH6 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fcf1Q9CTH6 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fcf1Q9CTH6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fcf1Q9CTH6 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fcf1Q9CTH6 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fcf1Q9CTH6 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fcf1Q9CTH6 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fcf1Q9CTH6 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fcf1Q9CTH6 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fcf1Q9CTH6 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Fcf1Q9CTH6 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Fcf1Q9CTH6 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Fcf1Q9CTH6 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fcf1Q9CTH6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fcf1Q9CTH6 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fcf1Q9CTH6 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fcf1Q9CTH6 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fcf1Q9CTH6 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fcf1Q9CTH6 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fcf1Q9CTH6 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fcf1Q9CTH6 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fcf1Q9CTH6 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fcf1Q9CTH6 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fcf1Q9CTH6 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fcf1Q9CTH6 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fcf1Q9CTH6 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fcf1Q9CTH6 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fcf1Q9CTH6 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fcf1Q9CTH6 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fcf1Q9CTH6 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fcf1Q9CTH6 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fcf1Q9CTH6 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Fcf1Q9CTH6 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Fcf1Q9CTH6 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Fcf1Q9CTH6 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fcf1Q9CTH6 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fcf1Q9CTH6 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fcf1Q9CTH6 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fcf1Q9CTH6 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fcf1Q9CTH6 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Fcf1Q9CTH6 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Fcf1Q9CTH6 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fcf1Q9CTH6 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fcf1Q9CTH6 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fcf1Q9CTH6 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fcf1Q9CTH6 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Fcf1Q9CTH6 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Fcf1Q9CTH6 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fcf1Q9CTH6 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fcf1Q9CTH6 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Fcf1Q9CTH6 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fcf1Q9CTH6 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Fcf1Q9CTH6 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fcf1Q9CTH6 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fcf1Q9CTH6 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fcf1Q9CTH6 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Fcf1Q9CTH6 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Fcf1Q9CTH6 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Fcf1Q9CTH6 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Fcf1Q9CTH6 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fcf1Q9CTH6 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fcf1Q9CTH6 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Fcf1Q9CTH6 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Fcf1Q9CTH6 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Fcf1Q9CTH6 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Fcf1Q9CTH6 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Fcf1Q9CTH6 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Fcf1Q9CTH6 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Fcf1Q9CTH6 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fcf1Q9CTH6 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fcf1Q9CTH6 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fcf1Q9CTH6 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fcf1Q9CTH6 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fcf1Q9CTH6 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fcf1Q9CTH6 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Fcf1Q9CTH6 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fcf1Q9CTH6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fcf1Q9CTH6 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fcf1Q9CTH6 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fcf1Q9CTH6 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fcf1Q9CTH6 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fcf1Q9CTH6 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fcf1Q9CTH6 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fcf1Q9CTH6 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Fcf1Q9CTH6 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fcf1Q9CTH6 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fcf1Q9CTH6 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fcf1Q9CTH6 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fcf1Q9CTH6 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fcf1Q9CTH6 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fcf1Q9CTH6 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
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