Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rprd1bQ9CSU0 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rprd1bQ9CSU0 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rprd1bQ9CSU0 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rprd1bQ9CSU0 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rprd1bQ9CSU0 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rprd1bQ9CSU0 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rprd1bQ9CSU0 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rprd1bQ9CSU0 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rprd1bQ9CSU0 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rprd1bQ9CSU0 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rprd1bQ9CSU0 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rprd1bQ9CSU0 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rprd1bQ9CSU0 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rprd1bQ9CSU0 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rprd1bQ9CSU0 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rprd1bQ9CSU0 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rprd1bQ9CSU0 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rprd1bQ9CSU0 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rprd1bQ9CSU0 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rprd1bQ9CSU0 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rprd1bQ9CSU0 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rprd1bQ9CSU0 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rprd1bQ9CSU0 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rprd1bQ9CSU0 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rprd1bQ9CSU0 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rprd1bQ9CSU0 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rprd1bQ9CSU0 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rprd1bQ9CSU0 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Rprd1bQ9CSU0 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rprd1bQ9CSU0 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rprd1bQ9CSU0 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rprd1bQ9CSU0 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rprd1bQ9CSU0 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rprd1bQ9CSU0 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rprd1bQ9CSU0 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rprd1bQ9CSU0 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rprd1bQ9CSU0 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rprd1bQ9CSU0 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rprd1bQ9CSU0 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rprd1bQ9CSU0 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rprd1bQ9CSU0 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rprd1bQ9CSU0 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rprd1bQ9CSU0 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rprd1bQ9CSU0 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Rprd1bQ9CSU0 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rprd1bQ9CSU0 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rprd1bQ9CSU0 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rprd1bQ9CSU0 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rprd1bQ9CSU0 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rprd1bQ9CSU0 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rprd1bQ9CSU0 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rprd1bQ9CSU0 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rprd1bQ9CSU0 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Rprd1bQ9CSU0 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rprd1bQ9CSU0 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rprd1bQ9CSU0 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rprd1bQ9CSU0 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rprd1bQ9CSU0 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rprd1bQ9CSU0 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rprd1bQ9CSU0 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rprd1bQ9CSU0 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rprd1bQ9CSU0 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rprd1bQ9CSU0 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rprd1bQ9CSU0 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rprd1bQ9CSU0 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rprd1bQ9CSU0 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rprd1bQ9CSU0 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rprd1bQ9CSU0 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rprd1bQ9CSU0 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Rprd1bQ9CSU0 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Rprd1bQ9CSU0 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Rprd1bQ9CSU0 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Rprd1bQ9CSU0 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rprd1bQ9CSU0 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rprd1bQ9CSU0 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rprd1bQ9CSU0 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rprd1bQ9CSU0 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rprd1bQ9CSU0 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rprd1bQ9CSU0 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rprd1bQ9CSU0 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rprd1bQ9CSU0 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rprd1bQ9CSU0 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rprd1bQ9CSU0 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rprd1bQ9CSU0 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rprd1bQ9CSU0 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rprd1bQ9CSU0 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rprd1bQ9CSU0 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rprd1bQ9CSU0 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rprd1bQ9CSU0 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rprd1bQ9CSU0 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rprd1bQ9CSU0 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rprd1bQ9CSU0 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rprd1bQ9CSU0 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Rprd1bQ9CSU0 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms