Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQU3

Rer1, Protein RER1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rer1Q9CQU3 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rer1Q9CQU3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rer1Q9CQU3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rer1Q9CQU3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rer1Q9CQU3 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rer1Q9CQU3 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rer1Q9CQU3 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rer1Q9CQU3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rer1Q9CQU3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rer1Q9CQU3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rer1Q9CQU3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rer1Q9CQU3 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rer1Q9CQU3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Rer1Q9CQU3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rer1Q9CQU3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rer1Q9CQU3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rer1Q9CQU3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rer1Q9CQU3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rer1Q9CQU3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rer1Q9CQU3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rer1Q9CQU3 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rer1Q9CQU3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rer1Q9CQU3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rer1Q9CQU3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rer1Q9CQU3 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rer1Q9CQU3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rer1Q9CQU3 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rer1Q9CQU3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rer1Q9CQU3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rer1Q9CQU3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rer1Q9CQU3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Rer1Q9CQU3 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rer1Q9CQU3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rer1Q9CQU3 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rer1Q9CQU3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rer1Q9CQU3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rer1Q9CQU3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rer1Q9CQU3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rer1Q9CQU3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rer1Q9CQU3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rer1Q9CQU3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rer1Q9CQU3 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rer1Q9CQU3 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Rer1Q9CQU3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Rer1Q9CQU3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rer1Q9CQU3 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rer1Q9CQU3 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rer1Q9CQU3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rer1Q9CQU3 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rer1Q9CQU3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rer1Q9CQU3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rer1Q9CQU3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rer1Q9CQU3 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rer1Q9CQU3 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rer1Q9CQU3 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Rer1Q9CQU3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rer1Q9CQU3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rer1Q9CQU3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rer1Q9CQU3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rer1Q9CQU3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rer1Q9CQU3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rer1Q9CQU3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rer1Q9CQU3 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rer1Q9CQU3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rer1Q9CQU3 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rer1Q9CQU3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rer1Q9CQU3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rer1Q9CQU3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rer1Q9CQU3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rer1Q9CQU3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rer1Q9CQU3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rer1Q9CQU3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rer1Q9CQU3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rer1Q9CQU3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rer1Q9CQU3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rer1Q9CQU3 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rer1Q9CQU3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rer1Q9CQU3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rer1Q9CQU3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rer1Q9CQU3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rer1Q9CQU3 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rer1Q9CQU3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rer1Q9CQU3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rer1Q9CQU3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rer1Q9CQU3 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rer1Q9CQU3 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rer1Q9CQU3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rer1Q9CQU3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rer1Q9CQU3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rer1Q9CQU3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rer1Q9CQU3 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rer1Q9CQU3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rer1Q9CQU3 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rer1Q9CQU3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rer1Q9CQU3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rer1Q9CQU3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rer1Q9CQU3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rer1Q9CQU3 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rer1Q9CQU3 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rer1Q9CQU3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms